Check text direction when merging readings

fold the live parts of graph.t into Collation.pm POD tests

Add a direction attribute to a collation for its graph display. Fixes #40

Operations that change readings as side effect should return those readings. #38

bugfix for case where duplicated reading has no language set

propagate normal form when it is changed on a lemma reading. #38

bump version numbers, indicate new dependency version for Morphology

Merge branch 'master' of https://github.com/tla/stemmatology

Move normal-form logc to Morphology.pm

Add logic for normalized form of lemma to propagate on orth/spelling links

add some proper CTE testing data

simple Arabic sample for later testing

fix rank assignment from JSON parsing. Fixes #34

fix a.c. witness parsing from JSON. Closes #32

store the tradition's new owner as well as the owner's new tradition(s)

remove tradition from old user too

updates to Directory.pm from tla/stemmaweb@3fe754ff

Directory changes needed for G+ signin; see tla/stemmaweb@7c6c2a1a

bump tiny version for test bugfix

Merge branch 'master' of https://github.com/tla/stemmatology

fix typo in Collation.pm test

release current version of persistence module

Release a new CPAN version of Analysis

bump a major version, to make life easier

Add test for compress_readings so that we can close #27

Stemweb job IDs no longer kill the parser. Fixes #28

Demonstrate failure mode for issue #28

Merge branch 'master' of https://github.com/tla/stemmatology

do_warn is an internal helper, not a public function. Fixes #31

try to fix test failure of #30

generate experimental adjacency list version of text

Accept and convert ASCIIfied witness names in Stemweb results. Addresses tla/stemmaweb#46

enable tabular output with ASCII sigla. Needed for tla/stemmaweb#46

add ASCII variant of sigil to witnesses. Needed for tla/stemmaweb#46

fix bugs in adjacency list generation; add tests

remove edge weight logic in dot; add adjacency list JSON output

produce stemma SVG with make_tradition

Merge branch 'master' of https://github.com/tla/stemmatology

Do a better sanity check on compress_readings. Addresses #43

capture warnings in a variable if asked

create the test dir if it doesn't already exist

add option to pass explicit path to pars executable

allow quick and dirty reading merge by relationship type in tab output

expose available relationship types for the collation

make CollateX parser recognize and cope with a.c. labels

suppress display of hyphens for joined-on punctuation

Note changes for release 1.3

POD fixes for base Text::Tradition package

use Set::Scalar comparison operator to compare sets. Addresses #24

turn char string into byte string before opening on FH. Addresses #23

try to make sure our error messages are strings

keep merging readings by rel type until no more exist. Fixes #22

return relationship significance info in analysis

save Ternary data type to graphml too

chase bug thrown up by merge_reading restriction; fix test that succeeded on a bad merge. (I hope) fixes #20.

move custom datatypes to their own package; add ternary is_significant to relationships. Needed for tla/stemmaweb#33

prevent merge_readings from causing witness loops

allow color specification for relationship links in SVG. Needed for tla/stemmaweb #34

add IDP script dependency to analysis package. #16

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

Work around MySQL storage encoding bug. Addresses #19

bump package version given non-back-compatibility of Relationship.pm changes. tla/stemmaweb#33

fix test failure

fix documentation for new relationship flags

Add function to expose relationship types from Collation object

tweak options for classifying readings and relationships. Needed for tla/stemmaweb#33

add method to collapse tradition by relationship

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

Add check for duplicate_reading that at least one witness remains for each reading. Fixes #18

Provide way to pass solver_url in options and fall back to default. Fixes #17

fix bug in IDP error logging

...and the updated test!

fix timezone-related minor test failure

remove abandoned 'forcequote' option logic

Collect all hacks for Graph::Reader::Dot into a single utility. Fixes #15

Rework Stemma / StemmaUtil so that utility functions are all in the latter. Fixes #14

change worker script to using 'say'; timestamp the log

Merge branch 'master' of https://github.com/tla/stemmatology

record error if applicable on analysis results

untaint Gearman IP/port for calling the worker

change calling of enum for RT ticket 90694

Add option to put sanitized layer labels in tabular output. Fixes #13 again

make sure we don't overwrite the cached alignment table with a noac request

enable output of CSV without witness layers. Fixes #13

associate Stemweb-generated stemmata with their job ID; return them on create. Needed for tla/stemmaweb#29

ensure graph names come through for undirected graphs too (tla/stemmaweb#28)

notice and save changes to graph name / stemma identifier (tla/stemmaweb#28)

add new dependency to Makefile for #12

finish and test record_stemweb_result for Tradition (#12)

ensure that undirected graphs stay undirected after parse. Fixes #11

added simple tests for CSV and TSV output. Fixes #8

make TEI-PS parser package variables safe for multiple invocations. Fixes #10

finish and test Stemma::root_graph method. Fixes #9

Add as_tsv routine for tab-sep export of collation. Fixes #7

get rid of erroneous double-decode

redirect STDOUT via local scope to catch bad graph

add support for named stemmata

initial hooks for Stemweb integration

pull out direct DBI connection horribleness into separate method

add test that demonstrates breakage with user deletion