a little light refactoring

add benchmarking; turn on all files

move scripts into script/

just export variants; Analysis really needs a refactor now.

progress, though still not 100%

remove deprecated Position and Segment modules

ignore BBEdit files

stop tracking bbedit stuff; first pass at Collate! parsing

wrapperize the HTML templates

grey out any stemma node not in the collation

split tree pruning into its own function; s158 works now

algorithm now works on 'besoin' txt, complex as it is

change analysis graph calculation - closer but not correct yet.

fix bugs to do with reading relationships

make standalone svg rendering inside an HTML page

allow division of fetch for table and SVG stemma

no need for default in non-Root

amazingly stupid pod bug

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

allow parameter passing too for stemmagraph service

Changed styling of selected row. Added auto styling of SVG.

add simple conversion service, dot to stemma graph

more test data

CollateX: no ranks if nonlinear
Analysis: fix bug in conflict detection

allow automatic sizing of stemma; put more data into the visualizer

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

Added coloting of polygons.

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

cope with multi-word graph names, catch rankless nodes

Change interactive color coding.

parse KUL text properly

add some final statistics; try to color anonymous nodes too

some more look and feel tweaks

save the name of the text too

add conflict styling to analysis table

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

Added color scheme for later reference.

don't track build artifacts

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

Touched styling for .genealogical.

assume UTF-8 on tabular files

update parse interface; remove HTML output

remove some data files

Touched style again.

Touched styling.

Added a lot of files for styling.

Added styling for clicked row.

Adde styling.

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

No changes, just syncing.

add lacunose witnesses to html rendering

Tried to implement node coloring.

continued doc and testing drive; rationalize GraphML a little

move around some doc/testing logic

fix Tabular parser to account for a.c. wits; more doc and tests

fix perldoc

restore file needed for graph.t test

document and unit-test Witness.pm

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

start documenting and testing

changed interface for Tradition init

new change from Joris

allow either file or string to be passed for parsing

add lacunae properly at start of TEI parsing

set up some real test data

fix acquisition of rank for row

changes requested by Joris

package for use by catalyst

Create wrapper model class for faster page load

lacuna nodes need to be marked as such on read

initial commit of Catalyst skeleton app

more work on our own graphml format

fix graphml write/read of relationship data

Fix graphml output / input format

work in progress

keep module dependencies in sync

keep module dependencies in sync

ignore data symlink dir

flatten identical nodes by rank; allow alignment table with objects

do automatic APSP calculation when a tree is saved or calculated

add BBedit project file

provide for stemma graphic display

add facility in Stemma for distance tree alongside hypothesis; use this for group_vars analysis

small efficiency tweak

first forays in variant analysis

Parse a known stemma hypothesis from a dotfile

Bugfix for superfluous a.c. witnesses

Allow either row or column orientation for alignment table

start handling CTE output files

add support for lacunas within the witnesses

add support for alignment table input

get rid of common reading calculation for positional fun

various things; headline change is reworking of node positions

CHECKPOINT for laptop migration

dot generation works on collation output TEI, svg generation does not

checkpoint, not sure what is here

add first-cut module for stemma analysis

new position logic for the lemmatizer and toggler; still need non-linear positions

new positioning system, works great for graph, needs work for CSV

make relationships work, add some hacks for Boodts collation