User store functionality actually in Directory; migrate changes there
[scpubgit/stemmatology.git] / lib / Text / Tradition / Directory.pm
index 9db309e..0d7a2f9 100644 (file)
@@ -3,93 +3,610 @@ package Text::Tradition::Directory;
 use strict;
 use warnings;
 use Moose;
+use DBI;
+use Encode qw/ decode_utf8 /;
+use KiokuDB::GC::Naive;
 use KiokuDB::TypeMap;
 use KiokuDB::TypeMap::Entry::Naive;
+use Text::Tradition::Error;
+
+## users
+use KiokuX::User::Util qw(crypt_password);
+use Text::Tradition::User;
 
 extends 'KiokuX::Model';
 
-has data_hash => (
-    traits => ['Hash'],
-       default => sub { {} },
-    handles => {
-        tradition     => 'get',
-        stemma           => 'get',
-        add_tradition => 'set',
-        add_stemma       => 'set',
-        traditions    => 'keys',
-    },
-);
+=head1 NAME
+
+Text::Tradition::Directory - a KiokuDB interface for storing and retrieving traditions
+
+=head1 SYNOPSIS
+
+  use Text::Tradition::Directory;
+  my $d = Text::Tradition::Directory->new( 
+    'dsn' => 'dbi:SQLite:mytraditions.db',
+    'extra_args' => { 'create' => 1 },
+  );
+  
+  my $tradition = Text::Tradition->new( @args );
+  my $stemma = $tradition->add_stemma( dotfile => $dotfile ); 
+  $d->save_tradition( $tradition );
+  
+  foreach my $id ( $d->traditions ) {
+       print $d->tradition( $id )->name;
+  }
+
+  ## Users:
+  my $userstore = Text::Tradition::UserStore->new(dsn => 'dbi:SQLite:foo.db');
+  my $newuser = $userstore->add_user({ username => 'fred',
+                                       password => 'somepassword' });
+
+  my $fetchuser = $userstore->find_user({ username => 'fred' });
+  if($fetchuser->check_password('somepassword')) { 
+     ## login user or .. whatever
+  }
+
+  my $user = $userstore->deactivate_user({ username => 'fred' });
+  if(!$user->active) { 
+    ## shouldnt be able to login etc
+  }
+    
+=head1 DESCRIPTION
+
+Text::Tradition::Directory is an interface for storing and retrieving text traditions and all their data, including an associated stemma hypothesis.  It is an instantiation of a KiokuDB::Model, storing traditions and associated stemmas by UUID.
+
+=head1 ATTRIBUTES
+
+=head2 MIN_PASS_LEN
+
+Constant for the minimum password length when validating passwords,
+defaults to "8".
+
+=cut
+
+has MIN_PASS_LEN => ( is => 'ro', isa => 'Num', default => sub { 8 } );
+
+=head1 METHODS
+
+=head2 new
+
+Returns a Directory object. 
+
+=head2 traditionlist
+
+Returns a hashref mapping of ID => name for all traditions in the directory.
+
+=head2 tradition( $id )
+
+Returns the Text::Tradition object of the given ID.
+
+=head2 save( $tradition )
+
+Writes the given tradition to the database, returning its ID.
+
+=head2 delete( $tradition )
+
+Deletes the given tradition object from the database.
+WARNING!! Garbage collection does not yet work. Use this sparingly.
+
+=begin testing
+
+use TryCatch;
+use File::Temp;
+use Text::Tradition;
+use_ok 'Text::Tradition::Directory';
+
+my $fh = File::Temp->new();
+my $file = $fh->filename;
+$fh->close;
+my $dsn = "dbi:SQLite:dbname=$file";
+my $uuid;
+my $t = Text::Tradition->new( 
+       'name'  => 'inline', 
+       'input' => 'Tabular',
+       'file'  => 't/data/simple.txt',
+       );
+
+{
+       my $d = Text::Tradition::Directory->new( 'dsn' => $dsn,
+               'extra_args' => { 'create' => 1 } );
+       is( ref $d, 'Text::Tradition::Directory', "Got directory object" );
        
-has typemap => (
-       is => 'rw',
-       isa => 'KiokuDB::TypeMap',
-       default => sub { 
-               KiokuDB::TypeMap->new(
-                       isa_entries => {
-                               "Graph::Easy::Base" => KiokuDB::TypeMap::Entry::Naive->new,
-                               "Graph" => KiokuDB::TypeMap::Entry::Naive->new,
-                               "Graph::AdjacencyMap" => KiokuDB::TypeMap::Entry::Naive->new,
-                       }
-               );
-       },
-);
+       my $scope = $d->new_scope;
+       $uuid = $d->save( $t );
+       ok( $uuid, "Saved test tradition" );
+       
+       my $s = $t->add_stemma( dotfile => 't/data/simple.dot' );
+       ok( $d->save( $t ), "Updated tradition with stemma" );
+       is( $d->tradition( $uuid ), $t, "Correct tradition returned for id" );
+       is( $d->tradition( $uuid )->stemma(0), $s, "...and it has the correct stemma" );
+       try {
+               $d->save( $s );
+       } catch( Text::Tradition::Error $e ) {
+               is( $e->ident, 'database error', "Got exception trying to save stemma directly" );
+               like( $e->message, qr/Cannot directly save non-Tradition object/, 
+                       "Exception has correct message" );
+       }
+}
+my $nt = Text::Tradition->new(
+       'name' => 'CX',
+       'input' => 'CollateX',
+       'file' => 't/data/Collatex-16.xml',
+       );
+is( ref( $nt ), 'Text::Tradition', "Made new tradition" );
 
-around 'tradition' => sub {
-       my( $orig, $self, @arg ) = @_;
-       my $data = $self->$orig( @arg );
-       return $data->{'object'};
-};
+{
+       my $f = Text::Tradition::Directory->new( 'dsn' => $dsn );
+       my $scope = $f->new_scope;
+       is( scalar $f->traditionlist, 1, "Directory index has our tradition" );
+       my $nuuid = $f->save( $nt );
+       ok( $nuuid, "Stored second tradition" );
+       my @tlist = $f->traditionlist;
+       is( scalar @tlist, 2, "Directory index has both traditions" );
+       my $tf = $f->tradition( $uuid );
+       my( $tlobj ) = grep { $_->{'id'} eq $uuid } @tlist;
+       is( $tlobj->{'name'}, $tf->name, "Directory index has correct tradition name" );
+       is( $tf->name, $t->name, "Retrieved the tradition from a new directory" );
+       my $sid = $f->object_to_id( $tf->stemma(0) );
+       try {
+               $f->tradition( $sid );
+       } catch( Text::Tradition::Error $e ) {
+               is( $e->ident, 'database error', "Got exception trying to fetch stemma directly" );
+               like( $e->message, qr/not a Text::Tradition/, "Exception has correct message" );
+       }
+       try {
+               $f->delete( $sid );
+       } catch( Text::Tradition::Error $e ) {
+               is( $e->ident, 'database error', "Got exception trying to delete stemma directly" );
+               like( $e->message, qr/Cannot directly delete non-Tradition object/, 
+                       "Exception has correct message" );
+       }
+       
+       $f->delete( $uuid );
+       ok( !$f->exists( $uuid ), "Object is deleted from DB" );
+       ok( !$f->exists( $sid ), "Object stemma also deleted from DB" );
+       is( scalar $f->traditionlist, 1, "Object is deleted from index" );
+}
 
-around 'stemma' => sub {
-       my( $orig, $self, @arg ) = @_;
-       my $data = $self->$orig( @arg );
-       return $data->{'stemma'};
-};
+{
+       my $g = Text::Tradition::Directory->new( 'dsn' => $dsn );
+       my $scope = $g->new_scope;
+       is( scalar $g->traditionlist, 1, "Now one object in new directory index" );
+       my $ntobj = $g->tradition( 'CX' );
+       my @w1 = sort { $a->sigil cmp $b->sigil } $ntobj->witnesses;
+       my @w2 = sort{ $a->sigil cmp $b->sigil } $nt->witnesses;
+       is_deeply( \@w1, \@w2, "Looked up remaining tradition by name" );
+}
+
+=end testing
 
-around 'add_tradition' => sub {
-       my( $orig, $self, $id, $obj ) = @_;
-       $self->$orig( $id => { 'object' => $obj } );
+=cut
+use Text::Tradition::TypeMap::Entry;
+
+has +typemap => (
+  is      => 'rw',
+  isa     => 'KiokuDB::TypeMap',
+  default => sub {
+    KiokuDB::TypeMap->new(
+      isa_entries => {
+        "Text::Tradition" =>
+          KiokuDB::TypeMap::Entry::Naive->new(),
+        "Graph" => Text::Tradition::TypeMap::Entry->new(),
+        "Graph::AdjacencyMap" => Text::Tradition::TypeMap::Entry->new(),
+      }
+    );
+  },
+);
+
+# Push some columns into the extra_args
+around BUILDARGS => sub {
+       my $orig = shift;
+       my $class = shift;
+       my $args;
+       if( @_ == 1 ) {
+               $args = $_[0];
+       } else {
+               $args = { @_ };
+       }
+       if( $args->{'dsn'} =~ /^dbi/ ) { # We're using Backend::DBI
+               my @column_args = ( 'columns',
+                       [ 'name' => { 'data_type' => 'varchar', 'is_nullable' => 1 } ] );
+               my $ea = $args->{'extra_args'};
+               if( ref( $ea ) eq 'ARRAY' ) {
+                       push( @$ea, @column_args );
+               } elsif( ref( $ea ) eq 'HASH' ) {
+                       $ea = { %$ea, @column_args };
+               } else {
+                       $ea = { @column_args };
+               }
+               $args->{'extra_args'} = $ea;
+       }
+       return $class->$orig( $args );
 };
 
-around 'add_stemma' => sub {
-       my( $orig, $self, $id, $obj ) = @_;
-       $self->{data_hash}->{$id}->{'stemma'} = $obj;
+## These checks don't cover store($id, $obj)
+# before [ qw/ store update insert delete / ] => sub {
+before [ qw/ delete / ] => sub {
+       my $self = shift;
+       my @nontrad;
+       foreach my $obj ( @_ ) {
+               if( ref( $obj ) && ref( $obj ) ne 'Text::Tradition'
+            && ref ($obj) ne 'Text::Tradition::User' ) {
+                       # Is it an id => Tradition hash?
+                       if( ref( $obj ) eq 'HASH' && keys( %$obj ) == 1 ) {
+                               my( $k ) = keys %$obj;
+                               next if ref( $obj->{$k} ) eq 'Text::Tradition';
+                       }
+                       push( @nontrad, $obj );
+               }
+       }
+       if( @nontrad ) {
+               throw( "Cannot directly save non-Tradition object of type "
+                       . ref( $nontrad[0] ) );
+       }
 };
 
-# Load all the relevant data from the DSN we were passed.
+# TODO Garbage collection doesn't work. Suck it up and live with the 
+# inflated DB.
+after delete => sub {
+       my $self = shift;
+       my $gc = KiokuDB::GC::Naive->new( backend => $self->directory->backend );
+       $self->directory->backend->delete( $gc->garbage->members );
+};
 
-sub BUILD {
+sub save {
        my $self = shift;
-       my $args = shift;
-       
-       if( exists $args->{'dsn'} ) {
-               # Connect to self, get the traditions and stemmas, and save them
-               # in the directory.
-               my $scope = $self->new_scope;
-               my $stream = $self->root_set;
-               my %stemmata;
-               until( $stream->is_done ) {
-                       foreach my $obj ( $stream->items ) {
-                               my $uuid = $self->object_to_id( $obj );
-                               if( ref( $obj ) eq 'Text::Tradition' ) {
-                                       $self->add_tradition( $uuid => $obj );
-                               } elsif( ref( $obj ) eq 'Text::Tradition::Stemma' ) {
-                                       $stemmata{$obj->collation} = $obj;
-                               } else {
-                                       warn "Found root object in DB that is neither tradition nor stemma: $obj";
-                               }
+       return $self->store( @_ );
+}
+
+sub tradition {
+       my( $self, $id ) = @_;
+       my $obj = $self->lookup( $id );
+       unless( $obj ) {
+               # Try looking up by name.
+               foreach my $item ( $self->traditionlist ) {
+                       if( $item->{'name'} eq $id ) {
+                               $obj = $self->lookup( $item->{'id'} );
+                               last;
                        }
                }
-               # Now match the stemmata to their traditions.
-               foreach my $id ( $self->traditions ) {
-                       my $c = $self->tradition( $id )->collation;
-                       if( exists $stemmata{$c} ) {
-                               $self->add_stemma( $id => $stemmata{$c} );
-                       }
+       }
+       if( $obj && ref( $obj ) ne 'Text::Tradition' ) {
+               throw( "Retrieved object is a " . ref( $obj ) . ", not a Text::Tradition" );
+       }
+       return $obj;
+}
+
+sub user_traditionlist {
+    my ($self, $user) = @_;
+
+    my @tlist;
+    if(ref $user && $user->is_admin) {
+        ## Admin sees all
+        return $self->traditionlist();
+    } elsif(ref $user) {
+        ## We have a user object already, so just fetch its traditions and use tose
+        foreach my $t (@{ $user->traditions }) {
+            push( @tlist, { 'id' => $self->object_to_id( $t ), 
+                            'name' => $t->name } );
+        }
+        return @tlist;
+    } elsif($user ne 'public') {
+        die "Passed neither a user object nor 'public' to user_traditionlist";
+    }
+    
+    ## Search for all traditions which allow public viewing
+    ## When they exist!
+## This needs to be more sophisticated, probably needs Search::GIN
+#    my $list = $self->search({ public => 1 });
+    
+    ## For now, just fetch all
+    ## (could use all_objects or grep down there?)
+    return $self->traditionlist();
+}
+
+sub traditionlist {
+       my $self = shift;
+    my ($user) = @_;
+
+    return $self->user_traditionlist($user) if($user);
+
+       my @tlist;
+       # If we are using DBI, we can do it the easy way; if not, the hard way.
+       # Easy way still involves making a separate DBI connection. Ew.
+       if( $self->dsn =~ /^dbi:(\w+):/ ) {
+               my $dbtype = $1;
+               my @connection = @{$self->directory->backend->connect_info};
+               # Get rid of KiokuDB-specific arg
+               pop @connection if scalar @connection > 4;
+               $connection[3]->{'sqlite_unicode'} = 1 if $dbtype eq 'SQLite';
+               $connection[3]->{'pg_enable_utf8'} = 1 if $dbtype eq 'Pg';
+               my $dbh = DBI->connect( @connection );
+               my $q = $dbh->prepare( 'SELECT id, name from entries WHERE class = "Text::Tradition"' );
+               $q->execute();
+               while( my @row = $q->fetchrow_array ) {
+                       my( $id, $name ) = @row;
+                       # Horrible horrible hack
+                       $name = decode_utf8( $name ) if $dbtype eq 'mysql';
+                       push( @tlist, { 'id' => $row[0], 'name' => $row[1] } );
                }
+       } else {
+               $self->scan( sub { my $o = shift; 
+                                                  push( @tlist, { 'id' => $self->object_to_id( $o ), 
+                                                                                  'name' => $o->name } ) } );
        }
+       return @tlist;
+}
+
+sub throw {
+       Text::Tradition::Error->throw( 
+               'ident' => 'database error',
+               'message' => $_[0],
+               );
+}
+
+
+# has 'directory' => ( 
+#     is => 'rw', 
+#     isa => 'KiokuX::Model',
+#     handles => []
+#     );
+
+## TODO: Some of these methods should probably optionally take $user objects
+## instead of hashrefs.
+
+## It also occurs to me that all these methods don't need to be named
+## XX_user, but leaving that way for now incase we merge this code
+## into ::Directory for one-store.
+
+## To die or not to die, on error, this is the question.
+
+=head2 add_user
+
+Takes a hashref of C<username>, C<password>.
+
+Create a new user object, store in the KiokuDB backend, and return it.
+
+=cut
+
+sub add_user {
+    my ($self, $userinfo) = @_;
+
+    my $username = $userinfo->{username};
+    my $password = $userinfo->{password};
+    my $role = $userinfo->{role} || 'user';
+
+       throw( "No username given" ) unless $username;
+       throw( "Invalid password - must be at least " . $self->MIN_PASS_LEN 
+               . " characters long" )
+               unless ( $self->validate_password($password) || $username =~ /^https?:/ );
+
+    my $user = Text::Tradition::User->new(
+        id => $username,
+        password => ($password ? crypt_password($password) : ''),
+        email => ($userinfo->{email} ? $userinfo->{email} : $username),
+        role => $role,
+    );
+
+    $self->store($user->kiokudb_object_id, $user);
+
+    return $user;
+}
+
+sub create_user {
+    my ($self, $userinfo) = @_;
+
+    ## No username means probably an OpenID based user
+    if(!exists $userinfo->{username}) {
+        extract_openid_data($userinfo);
+    }
+
+    return $self->add_user($userinfo);
+}
+
+## Not quite sure where this method should be.. Auth /
+## Credential::OpenID just pass us back the chunk of extension data
+sub extract_openid_data {
+    my ($userinfo) = @_;
+
+    ## Spec says SHOULD use url as identifier
+    $userinfo->{username} = $userinfo->{url};
+
+    ## Use email addy as display if available
+    if(exists $userinfo->{extensions} &&
+         exists $userinfo->{extensions}{'http://openid.net/srv/ax/1.0'} &&
+         defined $userinfo->{extensions}{'http://openid.net/srv/ax/1.0'}{'value.email'}) {
+        ## Somewhat ugly attribute extension reponse, contains
+        ## google-email string which we can use as the id
+
+        $userinfo->{email} = $userinfo->{extensions}{'http://openid.net/srv/ax/1.0'}{'value.email'};
+    }
+
+    return;
+}
+
+=head2 find_user
+
+Takes a hashref of C<username>, and possibly openIDish results from
+L<Net::OpenID::Consumer>.
+
+Fetches the user object for the given username and returns it.
+
+=cut
+
+sub find_user {
+    my ($self, $userinfo) = @_;
+
+    ## No username means probably an OpenID based user
+    if(!exists $userinfo->{username}) {
+        extract_openid_data($userinfo);
+    }
+
+    my $username = $userinfo->{username};
+
+    ## No logins if user is deactivated (use lookup to fetch to re-activate)
+    my $user = $self->lookup(Text::Tradition::User->id_for_user($username));
+    return if(!$user || !$user->active);
+
+    print STDERR "Found user, $username, email is :", $user->email, ":\n";
+
+    return $user;
+}
+
+=head2 modify_user
+
+Takes a hashref of C<username> and C<password> (same as add_user).
+
+Retrieves the user, and updates it with the new information. Username
+changing is not currently supported.
+
+Returns the updated user object, or undef if not found.
+
+=cut
+
+sub modify_user {
+    my ($self, $userinfo) = @_;
+    my $username = $userinfo->{username};
+    my $password = $userinfo->{password};
+    my $role = $userinfo->{role};
+
+    throw( "Missing username or bad password" )
+       unless $username && $self->validate_password($password);
+
+    my $user = $self->find_user({ username => $username });
+    throw( "Could not find user $username" ) unless $user;
+
+    if($password) {
+        $user->password(crypt_password($password));
+    }
+    if($role) {
+        $user->role($role);
+    }
+
+    $self->update($user);
+
+    return $user;
+}
+
+=head2 deactivate_user
+
+Takes a hashref of C<username>.
+
+Sets the users C<active> flag to false (0), and sets all traditions
+assigned to them to non-public, updates the storage and returns the
+deactivated user.
+
+Returns undef if user not found.
+
+=cut
+
+sub deactivate_user {
+    my ($self, $userinfo) = @_;
+    my $username = $userinfo->{username};
+
+    throw( "Need to specify a username for deactivation" ) unless $username;
+
+    my $user = $self->find_user({ username => $username });
+    throw( "User $username not found" ) unless $user;
+
+    $user->active(0);
+    foreach my $tradition (@{ $user->traditions }) {
+        ## Not implemented yet
+        # $tradition->public(0);
+    }
+
+    ## Should we be using Text::Tradition::Directory also?
+    $self->update(@{ $user->traditions });
+
+    $self->update($user);
+
+    return $user;
+}
+
+=head2 reactivate_user
+
+Takes a hashref of C<username>.
+
+Returns the user object if already activated. Activates (sets the
+active flag to true (1)), updates the storage and returns the user.
+
+Returns undef if the user is not found.
+
+=cut
+
+sub reactivate_user {
+    my ($self, $userinfo) = @_;
+    my $username = $userinfo->{username};
+
+    throw( "Need to specify a username for reactivation" ) unless $username;
+
+    my $user = $self->lookup(Text::Tradition::User->id_for_user($username));
+    throw( "User $username not found" ) unless $user;
+
+    return $user if $user->active;
+
+    $user->active(1);
+    $self->update($user);
+
+    return $user;    
+}
+
+=head2 delete_user
+
+CAUTION: Deletes actual data!
+
+Takes a hashref of C<username>.
+
+Returns undef if the user doesn't exist.
+
+Removes the user from the store and returns 1.
+
+=cut
+
+sub delete_user {
+    my ($self, $userinfo) = @_;
+    my $username = $userinfo->{username};
+
+    throw( "Need to specify a username for deletion" ) unless $username;
+
+    my $user = $self->find_user({ username => $username });
+    throw( "User $username not found" ) unless $user;
+
+    ## Should we be using Text::Tradition::Directory for this bit?
+    $self->delete( @{ $user->traditions });
+
+    ## Poof, gone.
+    $self->delete($user);
+
+    return 1;
+}
+
+=head2 validate_password
+
+Takes a password string. Returns true if it is longer than
+L</MIN_PASS_LEN>, false otherwise.
+
+Used internally by L</add_user>.
+
+=cut
+
+sub validate_password {
+    my ($self, $password) = @_;
+
+    return if !$password;
+    return if length($password) < $self->MIN_PASS_LEN;
+
+    return 1;
 }
 
 1;
-               
-               
\ No newline at end of file
+       
+=head1 LICENSE
+
+This package is free software and is provided "as is" without express
+or implied warranty.  You can redistribute it and/or modify it under
+the same terms as Perl itself.
+
+=head1 AUTHOR
+
+Tara L Andrews E<lt>aurum@cpan.orgE<gt>