t/stemma.t

   1 #!/usr/bin/perl
   2
   3 use strict; use warnings;
   4 use Test::More;
   5 use lib 'lib';
   6 use Text::Tradition;
   7 use XML::LibXML;
   8 use XML::LibXML::XPathContext;
   9
  10 my $datafile = 't/data/Collatex-16.xml'; #TODO need other test data
  11
  12 my $tradition = Text::Tradition->new(
  13     'name'  => 'inline',
  14     'input' => 'CollateX',
  15     'file'  => $datafile,
  16     );
  17 # Set up some relationships
  18 my $c = $tradition->collation;
  19 $c->add_relationship( 'n25', 'n26', { 'type' => 'spelling' } );
  20 $c->add_relationship( 'n9', 'n23', { 'type' => 'spelling' } );
  21 $c->add_relationship( 'n8', 'n13', { 'type' => 'spelling' } );
  22 $c->calculate_ranks();
  23
  24 my $stemma = $tradition->add_stemma( 't/data/simple.dot' );
  25
  26 # Test for object creation
  27 ok( $stemma->isa( 'Text::Tradition::Stemma' ), 'Got the right sort of object' );
  28 is( $stemma->graph, '1-2,1-A,2-B,2-C', "Got the correct graph" );
  29
  30 # Test for character matrix creation
  31 my $m = $stemma->make_character_matrix();
  32  ## check number of rows
  33 is( scalar @$m, 3, "Found three witnesses in char matrix" );
  34  ## check number of columns
  35 is( scalar( @{$m->[0]} ), 19, "Found 18 rows plus sigla in char matrix" );
  36  ## check matrix
  37 my %expected = (
  38         'A' => 'AAAAAAAXAAAAAAAAAA',
  39         'B' => 'AXXXAAAAAABABAABAA',
  40         'C' => 'AXXXAAAAABAAAAAXBB',
  41         );
  42 my @wits = map { shift @$_; } @$m;
  43 map { s/\s+//g } @wits;
  44 foreach my $i ( 0 .. $#wits ) {
  45         my $w = $wits[$i];
  46         is( join( '', @{$m->[$i]} ), $expected{$w}, "Row for witness $w is correct" );
  47 }
  48
  49 # Test that pars runs
  50 my( $status, $tree ) = $stemma->run_phylip_pars();
  51 ok( $status, "pars ran successfully" );
  52 print STDERR "Error was $tree\n" unless $status;
  53
  54 # Test that we get a tree
  55 is( scalar @{$stemma->distance_trees}, 1, "Got a single tree" );
  56 # Test that the tree has all our witnesses
  57 $tree = $stemma->distance_trees->[0];
  58 my @leaves = grep { $tree->degree( $_ ) == 1 } $tree->vertices;
  59 is( scalar @leaves, 3, "All witnesses in the tree" );
  60
  61 # Test our dot output
  62 my $display = $stemma->as_dot();
  63 ok( $display =~ /digraph/, "Got a dot display graph" );
  64 ok( $display !~ /hypothetical/, "Graph is display rather than edit" );
  65 # Test our editable output
  66 my $editable = $stemma->editable();
  67 ok( $editable =~ /digraph/, "Got a dot edit graph" );
  68 ok( $editable =~ /hypothetical/, "Graph contains an edit class" );
  69
  70 done_testing();