initialize stemma array in tradition
[scpubgit/stemmatology.git] / lib / Text / Tradition.pm
1 package Text::Tradition;
2
3 use Module::Load;
4 use Moose;
5 use Text::Tradition::Collation;
6 use Text::Tradition::Stemma;
7 use Text::Tradition::Witness;
8
9 use vars qw( $VERSION );
10 $VERSION = "0.1";
11
12 has 'collation' => (
13     is => 'ro',
14     isa => 'Text::Tradition::Collation',
15     writer => '_save_collation',
16     );
17
18 has 'witness_hash' => (
19     traits => ['Hash'],
20     isa => 'HashRef[Text::Tradition::Witness]',
21     handles => {
22         witness     => 'get',
23         add_witness => 'set',
24         del_witness => 'delete',
25         has_witness => 'exists',
26         witnesses   => 'values',
27     },
28     default => sub { {} },
29     );
30
31 has 'name' => (
32     is => 'rw',
33     isa => 'Str',
34     default => 'Tradition',
35     );
36     
37 has 'stemmata' => (
38         traits => ['Array'],
39         isa => 'ArrayRef[Text::Tradition::Stemma]',
40         handles => {
41                 all_stemmata => 'elements',
42                 _add_stemma => 'push',
43                 stemma => 'get',
44                 stemma_count => 'count',
45                 clear_stemmata => 'clear',
46         },
47         default => sub { [] },
48         );
49   
50 # Create the witness before trying to add it
51 around 'add_witness' => sub {
52     my $orig = shift;
53     my $self = shift;
54     # TODO allow add of a Witness object?
55     my $new_wit = Text::Tradition::Witness->new( @_ );
56     $self->$orig( $new_wit->sigil => $new_wit );
57     return $new_wit;
58 };
59
60 # Allow deletion of witness by object as well as by sigil
61 around 'del_witness' => sub {
62     my $orig = shift;
63     my $self = shift;
64     my @key_args;
65     foreach my $arg ( @_ ) {
66         push( @key_args, 
67               ref( $arg ) eq 'Text::Tradition::Witness' ? $arg->sigil : $arg );
68     }
69     return $self->$orig( @key_args );
70 };
71
72 # Don't allow an empty hash value
73 around 'witness' => sub {
74     my( $orig, $self, $arg ) = @_;
75     return unless $self->has_witness( $arg );
76     return $self->$orig( $arg );
77 };
78
79 =head1 NAME
80
81 Text::Tradition - a software model for a set of collated texts
82
83 =head1 SYNOPSIS
84
85   use Text::Tradition;
86   my $t = Text::Tradition->new( 
87     'name' => 'this is a text',
88     'input' => 'TEI',
89     'file' => '/path/to/tei_parallel_seg_file.xml' );
90
91   my @text_wits = $t->witnesses();
92   my $manuscript_a = $t->witness( 'A' );
93   my $new_ms = $t->add_witness( 'sigil' => 'B' );
94   
95   my $text_path_svg = $t->collation->as_svg();
96   ## See Text::Tradition::Collation for more on text collation itself
97     
98 =head1 DESCRIPTION
99
100 Text::Tradition is a library for representation and analysis of collated
101 texts, particularly medieval ones.  A 'tradition' refers to the aggregation
102 of surviving versions of a text, generally preserved in multiple
103 manuscripts (or 'witnesses').  A Tradition object thus has one more more
104 Witnesses, as well as a Collation that represents the unity of all versions
105 of the text.
106
107 =head1 METHODS
108
109 =head2 new
110
111 Creates and returns a new text tradition object.  The following options are
112 accepted.
113
114 General options:
115
116 =over 4
117
118 =item B<name> - The name of the text.
119
120 =back
121
122 Initialization based on a collation file:
123
124 =over 4
125
126 =item B<input> - The input format of the collation file.  Can be one of the
127 following:
128
129 =over 4
130
131 =item * Self - a GraphML format produced by this module
132
133 =item * CollateX - a GraphML format produced by CollateX
134
135 =item * CTE - a TEI XML format produced by Classical Text Editor
136
137 =item * JSON - an alignment table in JSON format, as produced by CollateX and other tools
138
139 =item * KUL - a specific CSV format for variants, not documented here
140
141 =item * TEI - a TEI parallel segmentation format file
142
143 =item * Tabular - a comma- or tab-separated collation.  Takes an additional
144 option, 'sep_char', which defaults to the tab character.
145
146 =back
147
148 =item B<file> - The name of the file that contains the data.  One of 'file'
149 or 'string' should be specified.
150
151 =item B<string> - A text string that contains the data.  One of 'file' or
152 'string' should be specified.
153
154 =item B<base> - The name of a text file that contains the base text, to be
155 used with input formats that require it (currently only KUL).
156
157 =back
158
159 Initialization based on a list of witnesses [NOT YET IMPLEMENTED]:
160
161 =over 4
162
163 =item B<witnesses> - A reference to an array of Text::Tradition::Witness
164 objects that carry the text to be collated.
165
166 =item B<collator> - A reference to a collation program that will accept
167 Witness objects.
168
169 =back
170
171 =head2 B<witnesses>
172
173 Return the Text::Tradition::Witness objects associated with this tradition,
174 as an array.
175
176 =head2 B<witness>( $sigil )
177
178 Returns the Text::Tradition::Witness object whose sigil is $sigil, or undef
179 if there is no such object within the tradition.
180
181 =head2 B<add_witness>( %opts )
182
183 Instantiate a new witness with the given options (see documentation for
184 Text::Tradition::Witness) and add it to the tradition.
185
186 =head2 B<del_witness>( $sigil )
187
188 Delete the witness with the given sigil from the tradition.  Returns the
189 witness object for the deleted witness.
190
191 =begin testing
192
193 use_ok( 'Text::Tradition', "can use module" );
194
195 my $t = Text::Tradition->new( 'name' => 'empty' );
196 is( ref( $t ), 'Text::Tradition', "initialized an empty Tradition object" );
197 is( $t->name, 'empty', "object has the right name" );
198 is( scalar $t->witnesses, 0, "object has no witnesses" );
199
200 my $simple = 't/data/simple.txt';
201 my $s = Text::Tradition->new( 
202     'name'  => 'inline', 
203     'input' => 'Tabular',
204     'file'  => $simple,
205     );
206 is( ref( $s ), 'Text::Tradition', "initialized a Tradition object" );
207 is( $s->name, 'inline', "object has the right name" );
208 is( scalar $s->witnesses, 3, "object has three witnesses" );
209
210 my $wit_a = $s->witness('A');
211 is( ref( $wit_a ), 'Text::Tradition::Witness', "Found a witness A" );
212 if( $wit_a ) {
213     is( $wit_a->sigil, 'A', "Witness A has the right sigil" );
214 }
215 is( $s->witness('X'), undef, "There is no witness X" );
216 ok( !exists $s->{'witnesses'}->{'X'}, "Witness key X not created" );
217
218 my $wit_d = $s->add_witness( 'sigil' => 'D' );
219 is( ref( $wit_d ), 'Text::Tradition::Witness', "new witness created" );
220 is( $wit_d->sigil, 'D', "witness has correct sigil" );
221 is( scalar $s->witnesses, 4, "object now has four witnesses" );
222
223 my $del = $s->del_witness( 'D' );
224 is( $del, $wit_d, "Deleted correct witness" );
225 is( scalar $s->witnesses, 3, "object has three witnesses again" );
226
227 # TODO test initialization by witness list when we have it
228
229 =end testing
230
231 =cut
232     
233
234 sub BUILD {
235     my( $self, $init_args ) = @_;
236
237     if( exists $init_args->{'witnesses'} ) {
238         # We got passed an uncollated list of witnesses.  Make a
239         # witness object for each witness, and then send them to the
240         # collator.
241         my $autosigil = 0;
242         foreach my $wit ( %{$init_args->{'witnesses'}} ) {
243             # Each item in the list is either a string or an arrayref.
244             # If it's a string, it is a filename; if it's an arrayref,
245             # it is a tuple of 'sigil, file'.  Handle either case.
246             my $args;
247             if( ref( $wit ) eq 'ARRAY' ) {
248                 $args = { 'sigil' => $wit->[0],
249                           'file' => $wit->[1] };
250             } else {
251                 $args = { 'sigil' => chr( $autosigil+65 ),
252                           'file' => $wit };
253                 $autosigil++;
254             }
255             $self->witnesses->add_witness( $args );
256             # TODO Now how to collate these?
257         }
258     } else {
259         # Else we need to parse some collation data.  Make a Collation object
260         my $collation = Text::Tradition::Collation->new( %$init_args,
261                                                         'tradition' => $self );
262         $self->_save_collation( $collation );
263
264         # Call the appropriate parser on the given data
265         my @format_standalone = qw/ Self CollateText CollateX CTE JSON TEI Tabular /;
266         my @format_basetext = qw/ KUL /;
267         my $use_base;
268         my $format = $init_args->{'input'};
269         if( $format && !( grep { $_ eq $format } @format_standalone )
270             && !( grep { $_ eq $format } @format_basetext ) ) {
271             warn "Unrecognized input format $format; not parsing";
272             return;
273         }
274         if( $format && grep { $_ eq $format } @format_basetext ) {
275             $use_base = 1;
276             if( !exists $init_args->{'base'} ) {
277                 warn "Cannot make a collation from $format without a base text";
278                 return;
279             }
280         }
281
282         # Now do the parsing. 
283         if( $format ) {
284             if( $use_base ) { 
285                 $format = 'BaseText';   # Use the BaseText module for parsing,
286                                         # but retain the original input arg.
287             }
288             my $mod = "Text::Tradition::Parser::$format";
289             load( $mod );
290             $mod->can('parse')->( $self, $init_args );
291         }
292     }
293 }
294
295 =head2 add_stemma( $dotfile )
296
297 Initializes a Text::Tradition::Stemma object from the given dotfile,
298 and associates it with the tradition.
299
300 =begin testing
301
302 use Text::Tradition;
303
304 my $t = Text::Tradition->new( 
305     'name'  => 'simple test', 
306     'input' => 'Tabular',
307     'file'  => 't/data/simple.txt',
308     );
309
310 is( $t->stemma_count, 0, "No stemmas added yet" );
311 my $s;
312 ok( $s = $t->add_stemma( dotfile => 't/data/simple.dot' ), "Added a simple stemma" );
313 is( ref( $s ), 'Text::Tradition::Stemma', "Got a stemma object returned" );
314 is( $t->stemma_count, 1, "Tradition claims to have a stemma" );
315 is( $t->stemma(0), $s, "Tradition hands back the right stemma" );
316
317 =end testing
318
319 =cut
320
321 sub add_stemma {
322         my $self = shift;
323         my %opts = @_;
324         my $stemma_fh;
325         if( $opts{'dotfile'} ) {
326                 open $stemma_fh, '<', $opts{'dotfile'}
327                         or warn "Could not open file " . $opts{'dotfile'};
328         } elsif( $opts{'dot'} ) {
329                 my $str = $opts{'dot'};
330                 open $stemma_fh, '<', \$str;
331         }
332         # Assume utf-8
333         binmode $stemma_fh, ':utf8';
334         my $stemma = Text::Tradition::Stemma->new( 
335                 'collation' => $self->collation,
336                 'dot' => $stemma_fh );
337         $self->_add_stemma( $stemma ) if $stemma;
338         return $stemma;
339 }
340
341 no Moose;
342 __PACKAGE__->meta->make_immutable;
343
344
345 =head1 BUGS / TODO
346
347 =over
348
349 =item * Allow tradition to be initialized via passing to a collator.
350
351 =back
352
353 =head1 LICENSE
354
355 This package is free software and is provided "as is" without express
356 or implied warranty.  You can redistribute it and/or modify it under
357 the same terms as Perl itself.
358
359 =head1 AUTHOR
360
361 Tara L Andrews E<lt>aurum@cpan.orgE<gt>