incorporate user auth functionality
[scpubgit/stemmatology.git] / lib / Text / Tradition.pm
1 package Text::Tradition;
2
3 use JSON qw / from_json /;
4 use Module::Load;
5 use Moose;
6 use Text::Tradition::Collation;
7 use Text::Tradition::Stemma;
8 use Text::Tradition::Witness;
9 use Text::Tradition::User;
10
11 use vars qw( $VERSION );
12 $VERSION = "0.5";
13
14 has 'collation' => (
15     is => 'ro',
16     isa => 'Text::Tradition::Collation',
17     writer => '_save_collation',
18     );
19
20 has 'witness_hash' => (
21     traits => ['Hash'],
22     isa => 'HashRef[Text::Tradition::Witness]',
23     handles => {
24         witness     => 'get',
25         add_witness => 'set',
26         del_witness => 'delete',
27         has_witness => 'exists',
28         witnesses   => 'values',
29     },
30     default => sub { {} },
31     );
32
33 has 'name' => (
34     is => 'rw',
35     isa => 'Str',
36     default => 'Tradition',
37     );
38     
39 has 'language' => (
40         is => 'rw',
41         isa => 'Str',
42         predicate => 'has_language',
43         );
44     
45 has 'stemmata' => (
46         traits => ['Array'],
47         isa => 'ArrayRef[Text::Tradition::Stemma]',
48         handles => {
49                 stemmata => 'elements',
50                 _add_stemma => 'push',
51                 stemma => 'get',
52                 stemma_count => 'count',
53                 clear_stemmata => 'clear',
54         },
55         default => sub { [] },
56         );
57   
58 has '_initialized' => (
59         is => 'ro',
60         isa => 'Bool',
61         default => undef,
62         writer => '_init_done',
63         ); 
64
65 has 'user' => (
66     is => 'rw',
67     isa => 'Text::Tradition::User',
68     required => 0,
69     predicate => 'has_user',
70     clearer => 'clear_user',
71     );
72
73 has 'public' => (
74     is => 'rw',
75     isa => 'Bool',
76     required => 0,
77     default => sub { 0; },
78     );
79
80 # Create the witness before trying to add it
81 around 'add_witness' => sub {
82     my $orig = shift;
83     my $self = shift;
84     # TODO allow add of a Witness object?
85     my %args = @_ == 1 ? %{$_[0]} : @_;
86     $args{'tradition'} = $self;
87     $args{'language'} = $self->language 
88         if( $self->language && !exists $args{'language'} );
89     my $new_wit = Text::Tradition::Witness->new( %args );
90     $self->$orig( $new_wit->sigil => $new_wit );
91     return $new_wit;
92 };
93
94 # Allow deletion of witness by object as well as by sigil
95 around 'del_witness' => sub {
96     my $orig = shift;
97     my $self = shift;
98     my @key_args;
99     foreach my $arg ( @_ ) {
100         push( @key_args, 
101               ref( $arg ) eq 'Text::Tradition::Witness' ? $arg->sigil : $arg );
102     }
103     return $self->$orig( @key_args );
104 };
105
106 # Don't allow an empty hash value
107 around 'witness' => sub {
108     my( $orig, $self, $arg ) = @_;
109     return unless $self->has_witness( $arg );
110     return $self->$orig( $arg );
111 };
112
113 =head1 NAME
114
115 Text::Tradition - a software model for a set of collated texts
116
117 =head1 SYNOPSIS
118
119   use Text::Tradition;
120   my $t = Text::Tradition->new( 
121     'name' => 'this is a text',
122     'input' => 'TEI',
123     'file' => '/path/to/tei_parallel_seg_file.xml' );
124
125   my @text_wits = $t->witnesses();
126   my $manuscript_a = $t->witness( 'A' );
127
128   $t = Text::Tradition->new();
129   $t->add_witness( 'sourcetype' => 'xmldesc', 
130     'file' => '/path/to/teitranscription.xml' );
131   $t->add_witness( 'sourcetype => 'plaintext', 'sigil' => 'Q',
132     'string' => 'The quick brown fox jumped over the lazy dogs' );
133   ## TODO
134   $t->collate_texts;
135   
136   my $text_path_svg = $t->collation->as_svg();
137   ## See Text::Tradition::Collation for more on text collation itself
138     
139 =head1 DESCRIPTION
140
141 Text::Tradition is a library for representation and analysis of collated
142 texts, particularly medieval ones.  A 'tradition' refers to the aggregation
143 of surviving versions of a text, generally preserved in multiple
144 manuscripts (or 'witnesses').  A Tradition object thus has one more more
145 Witnesses, as well as a Collation that represents the unity of all versions
146 of the text.
147
148 =head1 METHODS
149
150 =head2 new
151
152 Creates and returns a new text tradition object.  The following options are
153 accepted.
154
155 General options:
156
157 =over 4
158
159 =item B<name> - The name of the text.
160
161 =back
162
163 Initialization based on a collation file:
164
165 =over 4
166
167 =item B<input> - The input format of the collation file.  Can be one of the
168 following:
169
170 =over 4
171
172 =item * Self - a GraphML format produced by this module
173
174 =item * CollateX - a GraphML format produced by CollateX
175
176 =item * CTE - a TEI XML format produced by Classical Text Editor
177
178 =item * JSON - an alignment table in JSON format, as produced by CollateX and other tools
179
180 =item * KUL - a specific CSV format for variants, not documented here
181
182 =item * TEI - a TEI parallel segmentation format file
183
184 =item * Tabular - a comma- or tab-separated collation.  Takes an additional
185 option, 'sep_char', which defaults to the tab character.
186
187 =back
188
189 =item B<file> - The name of the file that contains the data.  One of 'file'
190 or 'string' should be specified.
191
192 =item B<string> - A text string that contains the data.  One of 'file' or
193 'string' should be specified.
194
195 =item B<base> - The name of a text file that contains the base text, to be
196 used with input formats that require it (currently only KUL).
197
198 =back
199
200 Initialization based on a list of witnesses [NOT YET IMPLEMENTED]:
201
202 =over 4
203
204 =item B<witnesses> - A reference to an array of Text::Tradition::Witness
205 objects that carry the text to be collated.
206
207 =item B<collator> - A reference to a collation program that will accept
208 Witness objects.
209
210 =back
211
212 =head2 B<witnesses>
213
214 Return the Text::Tradition::Witness objects associated with this tradition,
215 as an array.
216
217 =head2 B<witness>( $sigil )
218
219 Returns the Text::Tradition::Witness object whose sigil is $sigil, or undef
220 if there is no such object within the tradition.
221
222 =head2 B<add_witness>( %opts )
223
224 Instantiate a new witness with the given options (see documentation for
225 Text::Tradition::Witness) and add it to the tradition.
226
227 =head2 B<del_witness>( $sigil )
228
229 Delete the witness with the given sigil from the tradition.  Returns the
230 witness object for the deleted witness.
231
232 =begin testing
233
234 use_ok( 'Text::Tradition', "can use module" );
235
236 my $t = Text::Tradition->new( 'name' => 'empty' );
237 is( ref( $t ), 'Text::Tradition', "initialized an empty Tradition object" );
238 is( $t->name, 'empty', "object has the right name" );
239 is( scalar $t->witnesses, 0, "object has no witnesses" );
240
241 my $simple = 't/data/simple.txt';
242 my $s = Text::Tradition->new( 
243     'name'  => 'inline', 
244     'input' => 'Tabular',
245     'file'  => $simple,
246     );
247 is( ref( $s ), 'Text::Tradition', "initialized a Tradition object" );
248 is( $s->name, 'inline', "object has the right name" );
249 is( scalar $s->witnesses, 3, "object has three witnesses" );
250
251 my $wit_a = $s->witness('A');
252 is( ref( $wit_a ), 'Text::Tradition::Witness', "Found a witness A" );
253 if( $wit_a ) {
254     is( $wit_a->sigil, 'A', "Witness A has the right sigil" );
255 }
256 is( $s->witness('X'), undef, "There is no witness X" );
257 ok( !exists $s->{'witnesses'}->{'X'}, "Witness key X not created" );
258
259 my $wit_d = $s->add_witness( 'sigil' => 'D', 'sourcetype' => 'collation' );
260 is( ref( $wit_d ), 'Text::Tradition::Witness', "new witness created" );
261 is( $wit_d->sigil, 'D', "witness has correct sigil" );
262 is( scalar $s->witnesses, 4, "object now has four witnesses" );
263
264 my $del = $s->del_witness( 'D' );
265 is( $del, $wit_d, "Deleted correct witness" );
266 is( scalar $s->witnesses, 3, "object has three witnesses again" );
267
268 # TODO test initialization by witness list when we have it
269
270 =end testing
271
272 =cut
273     
274
275 sub BUILD {
276     my( $self, $init_args ) = @_;
277     
278     # First, make a collation object. This will use only those arguments in
279     # init_args that apply to the collation.
280         my $collation = Text::Tradition::Collation->new( %$init_args,
281                                                                                                         'tradition' => $self );
282         $self->_save_collation( $collation );
283
284     if( exists $init_args->{'input'} ) {
285         # Call the appropriate parser on the given data
286         my @format_standalone = qw/ Self CollateText CollateX CTE JSON TEI Tabular /;
287         my @format_basetext = qw/ KUL /;
288         my $use_base;
289         my $format = $init_args->{'input'};
290         if( $format && !( grep { $_ eq $format } @format_standalone )
291             && !( grep { $_ eq $format } @format_basetext ) ) {
292             warn "Unrecognized input format $format; not parsing";
293             return;
294         }
295         if( $format && grep { $_ eq $format } @format_basetext ) {
296             $use_base = 1;
297             if( !exists $init_args->{'base'} ) {
298                 warn "Cannot make a collation from $format without a base text";
299                 return;
300             }
301         }
302
303         # Now do the parsing. 
304         if( $format ) {
305             if( $use_base ) { 
306                 $format = 'BaseText';   # Use the BaseText module for parsing,
307                                         # but retain the original input arg.
308             }
309             my $mod = "Text::Tradition::Parser::$format";
310             load( $mod );
311             $mod->can('parse')->( $self, $init_args );
312         }
313     }
314     $self->_init_done( 1 );
315     return $self;
316 }
317
318 =head2 add_json_witnesses( $jsonstring, $options )
319
320 Adds a set of witnesses from a JSON array specification. This is a wrapper
321 to parse the JSON and call add_witness (with the specified $options) for
322 each element therein.
323
324 =cut
325
326 sub add_json_witnesses {
327         my( $self, $jsonstr, $extraopts ) = @_;
328         my $witarray = from_json( $jsonstr );
329         foreach my $witspec ( @{$witarray->{witnesses}} ) {
330                 my $opts = $extraopts || {};
331                 $opts->{'sourcetype'} = 'json';
332                 $opts->{'object'} = $witspec;
333                 $self->add_witness( $opts );
334         }
335 }
336
337 =head2 add_stemma( $dotfile )
338
339 Initializes a Text::Tradition::Stemma object from the given dotfile,
340 and associates it with the tradition.
341
342 =begin testing
343
344 use Text::Tradition;
345
346 my $t = Text::Tradition->new( 
347     'name'  => 'simple test', 
348     'input' => 'Tabular',
349     'file'  => 't/data/simple.txt',
350     );
351
352 is( $t->stemma_count, 0, "No stemmas added yet" );
353 my $s;
354 ok( $s = $t->add_stemma( dotfile => 't/data/simple.dot' ), "Added a simple stemma" );
355 is( ref( $s ), 'Text::Tradition::Stemma', "Got a stemma object returned" );
356 is( $t->stemma_count, 1, "Tradition claims to have a stemma" );
357 is( $t->stemma(0), $s, "Tradition hands back the right stemma" );
358
359 =end testing
360
361 =cut
362
363 sub add_stemma {
364         my $self = shift;
365         my %opts = @_;
366         my $stemma_fh;
367         if( $opts{'dotfile'} ) {
368                 open $stemma_fh, '<', $opts{'dotfile'}
369                         or warn "Could not open file " . $opts{'dotfile'};
370         } elsif( $opts{'dot'} ) {
371                 my $str = $opts{'dot'};
372                 open $stemma_fh, '<', \$str;
373         }
374         # Assume utf-8
375         binmode $stemma_fh, ':utf8';
376         my $stemma = Text::Tradition::Stemma->new( 
377                 'collation' => $self->collation,
378                 'dot' => $stemma_fh );
379         $self->_add_stemma( $stemma ) if $stemma;
380         return $stemma;
381 }
382
383 sub lemmatize {
384         my $self = shift;
385         unless( $self->has_language ) {
386                 warn "Please set a language to lemmatize a tradition";
387                 return;
388         }
389         my $mod = "Text::Tradition::Language::" . $self->language;
390         load( $mod );
391         $mod->can( 'lemmatize' )->( $self );
392 }
393
394 no Moose;
395 __PACKAGE__->meta->make_immutable;
396
397
398 =head1 BUGS / TODO
399
400 =over
401
402 =item * Allow tradition to be initialized via passing to a collator.
403
404 =back
405
406 =head1 LICENSE
407
408 This package is free software and is provided "as is" without express
409 or implied warranty.  You can redistribute it and/or modify it under
410 the same terms as Perl itself.
411
412 =head1 AUTHOR
413
414 Tara L Andrews E<lt>aurum@cpan.orgE<gt>