Add option to put sanitized layer labels in tabular output. Fixes #13 again

make sure we don't overwrite the cached alignment table with a noac request

enable output of CSV without witness layers. Fixes #13

associate Stemweb-generated stemmata with their job ID; return them on create. Needed for tla/stemmaweb#29

ensure graph names come through for undirected graphs too (tla/stemmaweb#28)

notice and save changes to graph name / stemma identifier (tla/stemmaweb#28)

add new dependency to Makefile for #12

finish and test record_stemweb_result for Tradition (#12)

ensure that undirected graphs stay undirected after parse. Fixes #11

added simple tests for CSV and TSV output. Fixes #8

make TEI-PS parser package variables safe for multiple invocations. Fixes #10

finish and test Stemma::root_graph method. Fixes #9

Add as_tsv routine for tab-sep export of collation. Fixes #7

get rid of erroneous double-decode

redirect STDOUT via local scope to catch bad graph

add support for named stemmata

initial hooks for Stemweb integration

pull out direct DBI connection horribleness into separate method

add test that demonstrates breakage with user deletion

Merge branch 'master' of https://github.com/tla/stemmatology

Revert "INCOMPLETE overhaul to CTE parsing core, issue #6"

This reverts commit c9f61c7056e267a816de9377efeee8b538b5c3d8.

Remove CTE parser revamp from master; this will go on a new branch.

This reverts commit 6f91b6f64c2d1de42d51797c8ba0d4ab27042118.

Make majority-path tagging optional. Useful for tla/stemmaweb#23

INCOMPLETE progress on CTE parser revamp for issue #6

INCOMPLETE overhaul to CTE parsing core, issue #6

dump relevant apparatus info for deleted nodes

CTE parser work in progress, debugging mostly

Fix remaining single quotes in main.idp

docs for IDP install, plus extra utility script

Slightly more informative closing message

add all graph solver support scripts

fixes to IDP scripts per Bart Bogaerts

Avoid an empty-string warning

...and remove debug statement

use TryCatch; bugfix for lacunae from START

XML parsers should accept already-parsed XML object too

Handle a2 app entries separately and more correctly. Fixes #5

More improvements to apparatus interpretation for CTE texts

minor tweaks to interpret() routine

Make graphcalc.cgi more configurable

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

initial commit of IDP scripts for stemma analysis

Current state of transposition parsing

Get rid of 'sic' notation in readings

nuke debugging statement

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

unlimited running on server

Add apparatus codicum support and witness long-identifier support to CTE parser. Fixes #2

bookkeeping for CPAN release

keep analysis scripts out of CPAN; make CHANGES file; increment versions for release

Return a relation, not a reading, in the invalid list. Issue tla/stemmaweb#17

Return deleted invalid noncolo relationships when a node is duped. Fixes #1

a little script cleanup

experimental script for vector cosine analysis

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

small but crucial bugfix in identical_readings for tla/stemmaweb#9

optionally delete only single instance of scoped rel; needed for tla/stemmaweb#4

let stringify_args pass all args; add test for reading dups

bugfix in identical_readings; optimization in duplicate_reading

pass through args from flatten_ranks to identical_readings

method to identify identical readings; make flatten_ranks use it

return the new reading generated on duplication

add method to duplicate a given relationship

new test file for collation correction

use output database as the userstore for tradition restoration

invalidate alignment table cache on relationship add if appropriate

field tested but unchecked changes, review ASAP

...and note the new testing dependency

don't forget to decode the sigla in XLSX too

refrain from calculating ranks in all parsers if asked; small optimizations to CTE parser

allow debugging svg to be made from CTE XML; say CTE debug messages

add in columns for excluding nothing

script bugfixes

do our indirect exclusions too

another script to exclude relatioship types in turn from the analysis

remove debug stmt

ignore collation rels; make multiparent and source relations visible in counts; new script for variation magnitude

corrected analysis script that gives raw numbers

analysis script for draft 2

get transposition a.c. gap recognized as a gap

try to deal with transposition + a.c. gap

all_related except for repetition

move analysis script; update Analysis.pm for new relationship regime

complete tests for relationship transitivity

add required description attribute for interface display

add option to list all relationship types

tweak relationship application order

let make_tradition parse excel files too

remove boneheaded DB line

slightly looser a.c. / p.c. parsing

need not tack on reltype

add testing placeholders

tested on all existing traditions, fixed bugs that arose

update test file to explicitly propagate implicit relationships

implement relationship logical propagation

utility script to stitch together split traditions

add relationship tests; move filter_collations to the parser where it's used

we cannot save coderefs, so stop trying; self parser fixes for new relationship regime

safer existence check

bugfix for applying base regularization