move language attribute away to morphology plugin

cosmetic fixes

change convenience dsn

distinguish between collation fuzzy normalization and orthographic regularization

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

some parser bugfixes / workarounds

switch IDP scripts to use better port 4730

reconcile our assumptions about transpositions with those of CollateX

first ugly stab at relationship links in SVG; add identifier to alignment

method to clear out collation object for re-collation

support limited witness sigil rename

enable language role plugin; require sigil for plaintext init

add witness role for collation regularization

new CPAN version of persistence module

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

add T::T and explicit version to package dependencies

git housekeeping

use witness sigil as graph node ID in SVG display

distribution housekeeping

support user lookup by email as well as id

stop altering SVG on server side; make transparent background

fix POD

make unsupported language non-fatal; correct exception raising

README fixes

add root-level README for the project

make sure all tests work in all combos, save the broken Directory deletion; POD doc updates and fixes

split out persistence / DB functionality

require methods we assume existence of; add Module::Load to Language

split tradition language into morphology module; add license blurb to morphology packages

load extensions statically to avoid bad object wrapping interactions

make test DB generation script work with new world order

exclude IDP scripts from CPAN dist

add version number

split out morphology; make all tests pass apart from morphology POD

split off stemma analysis modules from base Tradition layer

fix stemma test

Merge branch 'master' into phylo, deleting stemmaweb

Conflicts:
lib/Text/Tradition/Stemma.pm
stemmaweb/lib/stemmaweb/Controller/Root.pm
t/text_tradition_stemma.t

moved stemmaweb Catalyst stuff to its own repo

fix TODO statuses in tests

Merge branch 'master' into phylo

initial phylogeny generation work

include the about screen template

add main 'about' page, move most index page JS into componentload, rationalize the URL construction

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

Conflicts:
stemmaweb/lib/stemmaweb/Controller/Root.pm

update error http codes; guard against invalid stemma IDs

better error handling of missing / forbidden traditions

disable stdout capture for now since it breaks in production

attempt blind fix of mysterious syntax error

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

prevent Tradition from association collation with stemma

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

remove need for collation object from stemma

correct URLs for AJAX / img requests in stexaminer

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

disable email confirmation for now

scale viewbox along with width/height

add index page link to stexaminer and relmapper

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

Prettier buttons

remove unused code lines

fix logic bug for admin textinfo edit

allow for DB username/password passing

Better solution to greying and hovering pager buttons.

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

CSS fix

stemma button logic bugfix, streamline a little

hook up pager buttons to stemma loading; zap occasional error in upload success function

Styled buttons and pager

fix encoding bug in stemmadot input

let stexaminer run without IDP server reachable

catch XML parsing errors, and skip DTD loading that requires net

Implemented zoom and pan on sstemma.

many small bugfixes to display and server logic

fix logic bugs in stexaminer with explicit stemma specification

fix another bug in permissions logic

script to generate DB for web testing

catch dot syntax errors on stemma init

add stemma edit/add dialog, textinfo edit dialog, UI bugfixes mostly to error handling; still TODO stemma display after edit

handle Excel 2007+ parsing as well

enable XLS parsing in web controller

Add simple Excel 97-2004 spreadsheet parsing

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

Fixes and styling for upload error handling.

...and apply first ACL bugfix to relater/stexaminer

another ACL logic fix

handle file upload server responses

various & sundry small bugfixes

Integrated uploader and upload dialog.

initial pass at upload dialog

add user accounting; add tradition upload method

empty data fields before re-appending

restore accidentally deleted file

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

Some styling

add exception handling

get new front page working, if poorly styled

distinguish between user, admin, and public traditions; add preliminary app test

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

hide the unused dialog form in readonly mapper