fix various bugs

some debugger-friendly params

CollateX format for GraphML output changed; parser update

replace collation relationships whenever we can

change pt to px in stemma graphic

reconfigure stexaminer layout

Prune the groupings we get back from IDP

use the straighten hack whenever explicitly specified, subgraph or no

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

add JSON export function

make text_from_paths actually work

don't include 'collated' relationships in viewer

don't error on relationship deletion no-op

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

script to add orthographic links to case variants

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

add help text to relationship mapper

add help text to relationship mapper

morpho logic

fix bug in finding scoped relationships in some cases

allow case-insensitive relationships on all but orthography

more robust boolean value checking in tests

hooks for morphology tagging

more robust hack for IDP node name problem

refactor GraphML write/parse to use Moose introspection

try not to let collations interfere with relationship mapping

add a stats script, evade a perl bug, go back to hackier a.c. wit handling

perl solver works again too

fix last bugs, make stexaminer work under new regime

works now apart from the perl solver fallback

UNFINISHED change to Analysis to incorporate IDP solver

working fuller analysis plus tests

better analysis with more information

deal with global relationships

use new directory API

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

try to fix encoding issues in Directory name trawl

CPAN release, third time's the charm?

remove analysis tests from CPAN module too

release version 0.2 to cpan

merge readings properly based on join_* and wordsep

fix small logic bug in pre-existing scoped relationship detection

fix change detection bug

handle some cases for existing scoped relationships etc.

allow for prefix/suffix readings

add support for direct SQL query of directory

change Matthew hack, add language flag

small conveniences

as long as we are hacking...

make cmp_str a noop except for the tradition that needs it

save and display relationship annotations

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

save annotations made in relationship mapper

restore Directory deletion, albeit without garbage collection

restore Directory deletion, albeit without garbage collection

abandon 'collated' relationship removal

try to be smarter about recalculating rank and common readings

track the language of a text if applicable

don't run SVG tests unless dot is installed

turn off default debug

save created relationships; fix relative paths in css

reinstate useful_variant; better handling of AC wits

remove redundant a.c. witnesses from list

add JSON serialization method

leave git droppings out of perl package

pull new relationship mapper interface

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

revamp of Analysis.pm and associated changes

limit variant graph size

describe the graph format

refactored Analysis module with associated changes

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

modify alignment table API, to allow table caching

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

add relationship deletion functionality

get rid of debugging print

keep from caching subgraph svg

add SVG caching

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

add application launcher buttons for stexaminer and relationship mapper

some style modifications

get rid of undefined-value comparison warning

Small fix (null check on stemmagraph load).

fix JS paths

pull changes from lemmatizer

keep from stripping meta readings, oops

add facilities for removing 'collated' relationship, and for annotation

zap undefined value warning

remove distance tree stuff from Stemma object

post-processing script to get rid of punctuation

playing around with styles

bugfix from dispatcher

pull in recent changes from lemmatizer repository

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

path and API bugfixes

use new stemma interface

increase graph fontsize for better legibility

replace ugly layout hack with less hacky solution

huge pile of pod updates

initialize stemma array in tradition