fix glaring bug in relationship logic

allow specification of database UUID

fix Lexeme to handle empty wordform list input

add error handling for reading morphology update

use improvements in Lingua packages throughout our lexeme tagging

fix undefined bug in javascript for wordform-less lexemes

improvements to cat / feature listing

save any defined stemmata in GraphML

remove unconditional dep on Morph::Perseus

introspect for morphology values; include these in help; make sure Perseus results are unique

make relemmatize button work

morphology piece now works for main submit, not for relemmatization yet

muck about with serialization of lexeme wordforms; allow individual lexeme addressing

quick hack to make CTE-derived reading IDs valid XML names

refine some special case weirdness for Perseus

add morphology support for Latin, dependent on Perseus morphology

use modified Lingua::TreeTagger

refactor English/French shared TT logic into Base.pm

fix stupid undef quote error

fix Safari incompatibility; make ambiguous-morph nodes yellow; add relemmatize button

better autoselect logic; encapsulate creation of morphology elements

dblclick action now works; a little styling on dialog

morphology popup closer to working

request reading data on page load

make relationship app use SVG IDs; make (unused) form for reading info

fix dot/SVG output for (sub)start/end nodes and their IDs

serialize Lingua::Feature objects too

reading IDs must be XML names; now used in SVG node IDs

integrate updates from shared lemmatizer repo

use JSON for serialization rather than rolling own

read lexeme info in GraphML parsing

better lexeme serialization

naive serialization of lexems in GraphML

working version of rebuild_equivalence

allow dbuser/pass specification

add method for initializing/resetting equivalence graph

add English morph analysis; test for lurking debug statements

make French morphology use Lingua objects; add tests

clean up script dir a little

suppress relationship drawing on out-of-range nodes on global rel creation

repurpose outdated DB-save script as a DB-query script

Workarounds for a couple of bugs

pass $self to a method call, oops

make French morph tagging work; dependent on Flemm and TreeTagger

start implementing morphology on readings

fix bugs in persistent equivalence graph implementation

avoid collating meta readings

implement persistent equivalence graph for relationship tracking

check for relationship before collating

fix relationship test data; remove print from tab test

fix graphml subgraph generation; fix tab parsing to only set 'collated' where needed; add so-far-untried tests for transposition

add some more transposition logic

fix exponential loop in common_in_path

require working version of Text::TEI::Markup

workaround for segfault; slightly poor form GraphML but who cares?

overhaul of colocated-relationship validation, still segfaulting

factor out equivalence graph creation

add failing tests for relationship logic, next we fix them

add -from and -to options; TODO rationalize these across outputs

revert untested changes that were causing a segfault

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

enable graphml export of partial traditions

replace local with global rel if they are equivalent anyway

UNTESTED better validation for transpositions

wrap documentation strings

avoid dying on relationship conflicts

fix failing stemmaweb stub test

fix bug in transposition validation

drop collations on global relationship setting too

suppress undefined warnings in cycle death

bump version numbers

fix failing tests

retain original order of collation sets

remove deprecated source attribute

relationship deletions should include scoped objects

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

accessor method for fixing a database bug

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

Conflicts:
lib/Text/Tradition/Parser/CTE.pm

better handling of CTE files and their annoying hilight elements

only collate a given sequence once

add nocalc option for debug svg output

restore legacy attribute until we can remove it from db records

housekeeping, a bit of POD  addition

make XML witness parsing work

make the rest of the tests work with the new Witness

Merge branch 'master' into witnessparse

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

remove refs to deprecated relationship type 'meaning'

set text/layertext from witness JSON parse

get JSON witness parsing to work

make witness plaintext parsing work

make relationship mapper segments adapt to node+edge size of graph

make phylo tree generation work with script

only use applicable a.c. witnesses in stemma for analysis

fix a.c. handling on empty lemmata

remove 'meaning' relationship from interface too

remove 'meaning' relationship; apply fix to make ellipse text draggable

remove HACK from tradition build script

segment the large texts in the relationship mapper

add rudimentary logic for text segmentation in lemmatizer