revert untested changes that were causing a segfault

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

enable graphml export of partial traditions

replace local with global rel if they are equivalent anyway

UNTESTED better validation for transpositions

wrap documentation strings

avoid dying on relationship conflicts

fix failing stemmaweb stub test

fix bug in transposition validation

drop collations on global relationship setting too

suppress undefined warnings in cycle death

bump version numbers

fix failing tests

retain original order of collation sets

remove deprecated source attribute

relationship deletions should include scoped objects

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

accessor method for fixing a database bug

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

Conflicts:
lib/Text/Tradition/Parser/CTE.pm

better handling of CTE files and their annoying hilight elements

only collate a given sequence once

add nocalc option for debug svg output

restore legacy attribute until we can remove it from db records

housekeeping, a bit of POD  addition

make XML witness parsing work

make the rest of the tests work with the new Witness

Merge branch 'master' into witnessparse

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

remove refs to deprecated relationship type 'meaning'

set text/layertext from witness JSON parse

get JSON witness parsing to work

make witness plaintext parsing work

make relationship mapper segments adapt to node+edge size of graph

make phylo tree generation work with script

only use applicable a.c. witnesses in stemma for analysis

fix a.c. handling on empty lemmata

remove 'meaning' relationship from interface too

remove 'meaning' relationship; apply fix to make ellipse text draggable

remove HACK from tradition build script

segment the large texts in the relationship mapper

add rudimentary logic for text segmentation in lemmatizer

beginnings of addition of statistical info to stexaminer

better handling of a.c. witnesses in analysis

do proper quoting of unusual entity names in the dot

test for correctness of analysis groups; pursuant bugfixes

make path labels do the right thing with a.c. witnesses

bugfix in directory test script

refrain from counting hypotheticals in groups; fix bugs relating to array skew

only show 'interesting' variants in the stexaminer; send only witnesses
present in the stemma to the solvers

allow lookup by name as well as ID

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

add work-in-progress overlay, fix position of dialog overlay

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

reverting accidental file commits

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

CollateX format for GraphML output changed; parser update

fix various bugs

some debugger-friendly params

properly display & scale stemma graphs

CollateX format for GraphML output changed; parser update

replace collation relationships whenever we can

change pt to px in stemma graphic

reconfigure stexaminer layout

Prune the groupings we get back from IDP

use the straighten hack whenever explicitly specified, subgraph or no

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

add JSON export function

make text_from_paths actually work

don't include 'collated' relationships in viewer

don't error on relationship deletion no-op

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

script to add orthographic links to case variants

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

add help text to relationship mapper

add help text to relationship mapper

morpho logic

fix bug in finding scoped relationships in some cases

allow case-insensitive relationships on all but orthography

more robust boolean value checking in tests

hooks for morphology tagging

more robust hack for IDP node name problem

refactor GraphML write/parse to use Moose introspection

try not to let collations interfere with relationship mapping

add a stats script, evade a perl bug, go back to hackier a.c. wit handling

perl solver works again too

fix last bugs, make stexaminer work under new regime

works now apart from the perl solver fallback

UNFINISHED change to Analysis to incorporate IDP solver

working fuller analysis plus tests

better analysis with more information

deal with global relationships

use new directory API

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

try to fix encoding issues in Directory name trawl

CPAN release, third time's the charm?

remove analysis tests from CPAN module too

release version 0.2 to cpan

merge readings properly based on join_* and wordsep

fix small logic bug in pre-existing scoped relationship detection

fix change detection bug