CHECKPOINT untested and unfinished changes to BaseText

Our own variation on GraphML parsing

Merge branch 'master' of github.com:tla/stemmatology

CollateX version of GraphML parsing

we can parse our own graph output now

split out XML parsing logic from CollateX logic in parser

make one-witness-per-edge graphml output; still need to parse it properly

clean up svg output; allow non-linear GraphML graphs

handle repetition relationship

generate svg with relationships invisible; fix graphml output

first crack at implementing relationships

add some debug code for spotting apparatus double entries

fix circular-path bugs in the graph

working with new base text merge routine, up to line 25

CHECKPOINT untested pass at redoing base text merge

Merge branch 'moose' of github.com:tla/stemmatology into moose

Merge branch 'moose' of github.com:tla/stemmatology into moose

Conflicts:
script/svg_from_csv.pl

add expand/collapse path edge functionality

set up some real test data for csv collation

move scripts where they belong

got the graph calculated correctly from the spreadsheet

CHECKPOINT working on base text collation, need to fix path loops

UNTESTED saving work on base text parsing with new library

remove old files, no longer used

tests passing with new library, yay

BROKEN - making lemmatization work

some more rehoming of functionality

make the first couple of tests pass

use Moose for empty subclasses too

make some progress, also make perl -cw work

Start fleshing out some of these classes

First crack at a constructor

Start to switch to Moose

use transposition info from CollateX

initial steps toward position logic

made CSV parser standalone, lots of changes to Base, etc.

fixed node matching against many variants

Add some documentation

...and fix the namespace in the tests

Change namespace

Make transposition data go into pool arrays

Move some active node logic into the positions library

new library working with old graph functionality tests

Initial library