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nytprof run results of /variantgraph/<ID> and /relation/<ID>/relationships
[scpubgit/stemmatology.git] / stemmaweb / nytprof-runs / relation-uuid-relationships / Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html
diff --git a/stemmaweb/nytprof-runs/relation-uuid-relationships/Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html b/stemmaweb/nytprof-runs/relation-uuid-relationships/Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html
new file mode 100644 (file)
index 0000000..ef7b031
--- /dev/null
+++ b/stemmaweb/nytprof-runs/relation-uuid-relationships/Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html
@@ -0,0 +1,466 @@
+    <!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
+    <html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">
+<!--
+This file was generated by Devel::NYTProf version 4.06
+-->
+<head>
+    <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8" />
+    <meta http-equiv="Content-Language" content="en-us" />
+    <title>Profile of Bio/Phylo/Util/Exceptions.pm</title>
+<link rel="stylesheet" type="text/css" href="style.css" />
+    <script type="text/javascript" src="js/jquery-min.js"></script> 
+
+    <script type="text/javascript" src="js/jquery-tablesorter-min.js"></script> 
+    <link rel="stylesheet" type="text/css" href="js/style-tablesorter.css" />
+    <script type="text/javascript">
+    // when a column is first clicked on to sort it, use descending order
+    // XXX doesn't seem to work (and not just because the tablesorter formatSortingOrder() is broken)
+    $.tablesorter.defaults.sortInitialOrder = "desc";
+    // add parser through the tablesorter addParser method 
+    $.tablesorter.addParser({
+        id: 'fmt_time',   // name of this parser
+        is: function(s) { 
+            return false; // return false so this parser is not auto detected 
+        }, 
+        format: function(orig) { // format data for normalization 
+            // console.log(orig);
+            val = orig.replace(/ns/,'');
+            if (val != orig) { return val / (1000*1000*1000); } 
+            val = orig.replace(/µs/,''); /* XXX use &micro; ? */
+            if (val != orig) { return val / (1000*1000); } 
+            var val = orig.replace(/ms/,'');
+            if (val != orig) { return val / (1000); }
+            var val = orig.replace(/s/,'');
+            if (val != orig) { return val; }
+            if (orig == '0') { return orig; } 
+            console.log('no match for fmt_time of '.concat(orig));
+            return orig;
+        },
+        type: 'numeric' // set type, either numeric or text 
+    }); 
+    </script> 
+</head>
+
+<body > 
+<div class="header" style="position: relative; overflow-x: hidden; overflow-y: hidden; z-index: 0; ">
+<div class="header_back">
+            <a href="index.html">&larr; Index</a>
+        </div>
+<div class="headerForeground" style="float: left">
+    <span class="siteTitle">NYTProf Performance Profile</span>
+    <span class="siteSubtitle">&emsp;&emsp;<span>&laquo;&emsp;<span class="mode_btn"><a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-block.html">block view</a></span>&emsp;&bull;&emsp;<span class="mode_btn mode_btn_selected">line view</span>&emsp;&bull;&emsp;<span class="mode_btn"><a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-sub.html">sub view</a></span>&emsp;&raquo;</span><br />
+            For script/nytprof.pl
+        </span>
+</div>
+<div class="headerForeground" style="float: right; text-align: right">
+    <span class="siteTitle">&nbsp;</span>
+    <span class="siteSubtitle">Run on Thu May 31 16:49:15 2012<br />Reported on Thu May 31 16:55:36 2012</span>
+</div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 0%; width: 100%; height: 101%; z-index: -1; background-color: rgb(17, 136, 255); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 2%; width: 100%; height: 99%; z-index: -1; background-color: rgb(16, 134, 253); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 4%; width: 100%; height: 97%; z-index: -1; background-color: rgb(16, 133, 252); "></div>
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+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 8%; width: 100%; height: 93%; z-index: -1; background-color: rgb(15, 130, 249); "></div>
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+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 12%; width: 100%; height: 89%; z-index: -1; background-color: rgb(14, 127, 246); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 14%; width: 100%; height: 87%; z-index: -1; background-color: rgb(14, 126, 245); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 16%; width: 100%; height: 85%; z-index: -1; background-color: rgb(14, 125, 244); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 18%; width: 100%; height: 83%; z-index: -1; background-color: rgb(13, 123, 242); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 20%; width: 100%; height: 81%; z-index: -1; background-color: rgb(13, 122, 241); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 22%; width: 100%; height: 79%; z-index: -1; background-color: rgb(13, 121, 240); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 24%; width: 100%; height: 77%; z-index: -1; background-color: rgb(12, 119, 238); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 26%; width: 100%; height: 75%; z-index: -1; background-color: rgb(12, 118, 237); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 28%; width: 100%; height: 73%; z-index: -1; background-color: rgb(12, 116, 235); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 30%; width: 100%; height: 71%; z-index: -1; background-color: rgb(11, 115, 234); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 32%; width: 100%; height: 69%; z-index: -1; background-color: rgb(11, 114, 233); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 34%; width: 100%; height: 67%; z-index: -1; background-color: rgb(11, 112, 231); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 36%; width: 100%; height: 65%; z-index: -1; background-color: rgb(10, 111, 230); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 38%; width: 100%; height: 63%; z-index: -1; background-color: rgb(10, 110, 229); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 40%; width: 100%; height: 61%; z-index: -1; background-color: rgb(10, 108, 227); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 42%; width: 100%; height: 59%; z-index: -1; background-color: rgb(9, 107, 226); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 44%; width: 100%; height: 57%; z-index: -1; background-color: rgb(9, 106, 225); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 46%; width: 100%; height: 55%; z-index: -1; background-color: rgb(9, 104, 223); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 48%; width: 100%; height: 53%; z-index: -1; background-color: rgb(8, 103, 222); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 50%; width: 100%; height: 51%; z-index: -1; background-color: rgb(8, 102, 221); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 52%; width: 100%; height: 49%; z-index: -1; background-color: rgb(8, 100, 219); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 54%; width: 100%; height: 47%; z-index: -1; background-color: rgb(7, 99, 218); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 56%; width: 100%; height: 45%; z-index: -1; background-color: rgb(7, 97, 216); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 58%; width: 100%; height: 43%; z-index: -1; background-color: rgb(7, 96, 215); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 60%; width: 100%; height: 41%; z-index: -1; background-color: rgb(6, 95, 214); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 62%; width: 100%; height: 39%; z-index: -1; background-color: rgb(6, 93, 212); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 64%; width: 100%; height: 37%; z-index: -1; background-color: rgb(6, 92, 211); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 66%; width: 100%; height: 35%; z-index: -1; background-color: rgb(5, 91, 210); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 68%; width: 100%; height: 33%; z-index: -1; background-color: rgb(5, 89, 208); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 70%; width: 100%; height: 31%; z-index: -1; background-color: rgb(5, 88, 207); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 72%; width: 100%; height: 29%; z-index: -1; background-color: rgb(4, 87, 206); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 74%; width: 100%; height: 27%; z-index: -1; background-color: rgb(4, 85, 204); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 76%; width: 100%; height: 25%; z-index: -1; background-color: rgb(4, 84, 203); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 78%; width: 100%; height: 23%; z-index: -1; background-color: rgb(3, 82, 201); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 80%; width: 100%; height: 21%; z-index: -1; background-color: rgb(3, 81, 200); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 82%; width: 100%; height: 19%; z-index: -1; background-color: rgb(3, 80, 199); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 84%; width: 100%; height: 17%; z-index: -1; background-color: rgb(2, 78, 197); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 86%; width: 100%; height: 15%; z-index: -1; background-color: rgb(2, 77, 196); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 88%; width: 100%; height: 13%; z-index: -1; background-color: rgb(2, 76, 195); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 90%; width: 100%; height: 11%; z-index: -1; background-color: rgb(1, 74, 193); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 92%; width: 100%; height: 9%; z-index: -1; background-color: rgb(1, 73, 192); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 94%; width: 100%; height: 7%; z-index: -1; background-color: rgb(1, 72, 191); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 96%; width: 100%; height: 5%; z-index: -1; background-color: rgb(0, 70, 189); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 98%; width: 100%; height: 3%; z-index: -1; background-color: rgb(0, 69, 188); "></div>
+<div style="position: absolute; left: 0px; top: 100%; width: 100%; height: 1%; z-index: -1; background-color: rgb(0, 68, 187); "></div>
+</div>
+
+<div class="body_content"><br />
+<table class="file_summary"><tr><td class="h">Filename</td><td align="left"><a href="file:///Users/edenc/perl5/lib/perl5/Bio/Phylo/Util/Exceptions.pm">/Users/edenc/perl5/lib/perl5/Bio/Phylo/Util/Exceptions.pm</a></td></tr>
+<tr><td class="h">Statements</td><td align="left">Executed 119 statements in 2.53ms</td></tr></table>
+        
+        <table id="subs_table" border="1" cellpadding="0" class="tablesorter">
+        <caption>Subroutines</caption>
+        <thead>
+        <tr>
+        <th>Calls</th>
+        <th><span title="Number of Places sub is called from">P</span></th>
+        <th><span title="Number of Files sub is called from">F</span></th>
+        <th>Exclusive<br />Time</th>
+        <th>Inclusive<br />Time</th>
+        <th>Subroutine</th>
+        </tr>
+        </thead>
+    <tbody>
+<tr><td class="c3">1</td><td class="c3">1</td><td class="c3">1</td><td class="c0"><span title="0.0%">3.06ms</span></td><td class="c0"><span title="0.0%">3.96ms</span></td><td class="sub_name"><span style="display: none;">Bio::Phylo::Util::Exceptions::::_make_exceptions</span>Bio::Phylo::Util::Exceptions::<a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html#113">_make_exceptions</a></span></td></tr>
+<tr><td class="c3">1</td><td class="c3">1</td><td class="c3">1</td><td class="c0"><span title="0.0%">426&micro;s</span></td><td class="c0"><span title="0.0%">449&micro;s</span></td><td class="sub_name"><span style="display: none;">Bio::Phylo::Util::Exceptions::::BEGIN@4</span>Bio::Phylo::Util::Exceptions::<a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html#4">BEGIN@4</a></span></td></tr>
+<tr><td class="c3">1</td><td class="c3">1</td><td class="c3">1</td><td class="c3"><span title="0.0%">15&micro;s</span></td><td class="c3"><span title="0.0%">57&micro;s</span></td><td class="sub_name"><span style="display: none;">Bio::Phylo::Util::Exceptions::::BEGIN@6</span>Bio::Phylo::Util::Exceptions::<a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html#6">BEGIN@6</a></span></td></tr>
+<tr><td class="c3">1</td><td class="c3">1</td><td class="c3">1</td><td class="c3"><span title="0.0%">14&micro;s</span></td><td class="c3"><span title="0.0%">17&micro;s</span></td><td class="sub_name"><span style="display: none;">Bio::Phylo::Util::Exceptions::::BEGIN@2</span>Bio::Phylo::Util::Exceptions::<a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html#2">BEGIN@2</a></span></td></tr>
+<tr><td class="c3">1</td><td class="c3">1</td><td class="c3">1</td><td class="c3"><span title="0.0%">10&micro;s</span></td><td class="c3"><span title="0.0%">53&micro;s</span></td><td class="sub_name"><span style="display: none;">Bio::Phylo::Util::Exceptions::::BEGIN@5</span>Bio::Phylo::Util::Exceptions::<a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html#5">BEGIN@5</a></span></td></tr>
+<tr><td class="c3">1</td><td class="c3">1</td><td class="c3">1</td><td class="c3"><span title="0.0%">8&micro;s</span></td><td class="c3"><span title="0.0%">77&micro;s</span></td><td class="sub_name"><span style="display: none;">Bio::Phylo::Util::Exceptions::::BEGIN@3</span>Bio::Phylo::Util::Exceptions::<a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html#3">BEGIN@3</a></span></td></tr>
+<tr><td class="c3">0</td><td class="c3">0</td><td class="c3">0</td><td class="c3"><span title="0.0%">0s</span></td><td class="c3"><span title="0.0%">0s</span></td><td class="sub_name"><span style="display: none;">Bio::Phylo::Util::Exceptions::::AUTOLOAD</span>Bio::Phylo::Util::Exceptions::<a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html#106">AUTOLOAD</a></span></td></tr>
+<tr><td class="c3">0</td><td class="c3">0</td><td class="c3">0</td><td class="c3"><span title="0.0%">0s</span></td><td class="c3"><span title="0.0%">0s</span></td><td class="sub_name"><span style="display: none;">Bio::Phylo::Util::Exceptions::::__ANON__[:6]</span>Bio::Phylo::Util::Exceptions::<a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html#6">__ANON__[:6]</a></span></td></tr>
+<tr><td class="c3">0</td><td class="c3">0</td><td class="c3">0</td><td class="c3"><span title="0.0%">0s</span></td><td class="c3"><span title="0.0%">0s</span></td><td class="sub_name"><span style="display: none;">Bio::Phylo::Util::Exceptions::::as_string</span>Bio::Phylo::Util::Exceptions::<a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html#28">as_string</a></span></td></tr>
+<tr><td class="c3">0</td><td class="c3">0</td><td class="c3">0</td><td class="c3"><span title="0.0%">0s</span></td><td class="c3"><span title="0.0%">0s</span></td><td class="sub_name"><span style="display: none;">Bio::Phylo::Util::Exceptions::::caught</span>Bio::Phylo::Util::Exceptions::<a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html#91">caught</a></span></td></tr>
+<tr><td class="c3">0</td><td class="c3">0</td><td class="c3">0</td><td class="c3"><span title="0.0%">0s</span></td><td class="c3"><span title="0.0%">0s</span></td><td class="sub_name"><span style="display: none;">Bio::Phylo::Util::Exceptions::::new</span>Bio::Phylo::Util::Exceptions::<a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html#9">new</a></span></td></tr>
+<tr><td class="c3">0</td><td class="c3">0</td><td class="c3">0</td><td class="c3"><span title="0.0%">0s</span></td><td class="c3"><span title="0.0%">0s</span></td><td class="sub_name"><span style="display: none;">Bio::Phylo::Util::Exceptions::::rethrow</span>Bio::Phylo::Util::Exceptions::<a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html#86">rethrow</a></span></td></tr>
+<tr><td class="c3">0</td><td class="c3">0</td><td class="c3">0</td><td class="c3"><span title="0.0%">0s</span></td><td class="c3"><span title="0.0%">0s</span></td><td class="sub_name"><span style="display: none;">Bio::Phylo::Util::Exceptions::::throw</span>Bio::Phylo::Util::Exceptions::<a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html#52">throw</a></span></td></tr>
+</tbody></table>
+                Call graph for these subroutines as a
+                <a href="http://en.wikipedia.org/wiki/Graphviz">Graphviz</a>
+                <a href="Users-edenc-perl5-lib-perl5-Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm.dot">dot language file</a>.
+            
+      <table border="1" cellpadding="0">
+      <thead>
+      <tr><th>Line</th>
+      <th><span title="Number of statements executed">State<br />ments</span></th>
+      <th><span title="Time spend executing statements on the line,
+        excluding time spent executing statements in any called subroutines">Time<br />on line</span></th>
+      <th><span title="Number of subroutines calls">Calls</span></th>
+      <th><span title="Time spent in subroutines called (inclusive)">Time<br />in subs</span></th>
+      <th class="left_indent_header">Code</th>
+      </tr>
+
+      </thead>
+      <tbody>
+    <tr><td class="h"><a name="1"></a>1</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">package Bio::Phylo::Util::Exceptions;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="2"></a>2</td><td class="c3">2</td><td class="c3"><span title="Avg 13&micro;s">26&micro;s</span></td><td class="c3">2</td><td class="c3">20&micro;s</td><td class="s"><div class="calls"><div class="calls_in"># spent 17&micro;s (14+3) within Bio::Phylo::Util::Exceptions::BEGIN@2 which was called:
+#    once (14&micro;s+3&micro;s) by Bio::Phylo::Identifiable::BEGIN@3 at <a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html#2">line 2</a></div></div>use strict;<div class="calls"><div class="calls_out"># spent    17&micro;s making 1 call to <a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html#2">Bio::Phylo::Util::Exceptions::BEGIN@2</a>
+# spent     3&micro;s making 1 call to <a href="strict-pm-3-line.html#34">strict::import</a></div></div></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="3"></a>3</td><td class="c3">2</td><td class="c3"><span title="Avg 13&micro;s">27&micro;s</span></td><td class="c3">2</td><td class="c3">77&micro;s</td><td class="s"><div class="calls"><div class="calls_in"># spent 77&micro;s (8+69) within Bio::Phylo::Util::Exceptions::BEGIN@3 which was called:
+#    once (8&micro;s+69&micro;s) by Bio::Phylo::Identifiable::BEGIN@3 at <a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html#3">line 3</a></div></div>use base 'Exporter';<div class="calls"><div class="calls_out"># spent    77&micro;s making 1 call to <a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html#3">Bio::Phylo::Util::Exceptions::BEGIN@3</a>
+# spent    70&micro;s making 1 call to <a href="base-pm-22-line.html#58">base::import</a>, recursion: max depth 1, sum of overlapping time 70&micro;s</div></div></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="4"></a>4</td><td class="c3">2</td><td class="c0"><span title="Avg 54&micro;s">108&micro;s</span></td><td class="c3">2</td><td class="c0">452&micro;s</td><td class="s"><div class="calls"><div class="calls_in"># spent 449&micro;s (426+23) within Bio::Phylo::Util::Exceptions::BEGIN@4 which was called:
+#    once (426&micro;s+23&micro;s) by Bio::Phylo::Identifiable::BEGIN@3 at <a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html#4">line 4</a></div></div>use Bio::Phylo::Util::StackTrace;<div class="calls"><div class="calls_out"># spent   449&micro;s making 1 call to <a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html#4">Bio::Phylo::Util::Exceptions::BEGIN@4</a>
+# spent     3&micro;s making 1 call to <a href="UNIVERSAL-pm-738-line.html#16">UNIVERSAL::import</a></div></div></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="5"></a>5</td><td class="c3">2</td><td class="c1"><span title="Avg 31&micro;s">62&micro;s</span></td><td class="c3">2</td><td class="c3">97&micro;s</td><td class="s"><div class="calls"><div class="calls_in"># spent 53&micro;s (10+44) within Bio::Phylo::Util::Exceptions::BEGIN@5 which was called:
+#    once (10&micro;s+44&micro;s) by Bio::Phylo::Identifiable::BEGIN@3 at <a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html#5">line 5</a></div></div>use Scalar::Util 'blessed';<div class="calls"><div class="calls_out"># spent    53&micro;s making 1 call to <a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html#5">Bio::Phylo::Util::Exceptions::BEGIN@5</a>
+# spent    44&micro;s making 1 call to <a href="Exporter-pm-8-line.html#28">Exporter::import</a></div></div></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="6"></a>6</td><td class="c3">2</td><td class="c0"><span title="Avg 461&micro;s">922&micro;s</span></td><td class="c3">2</td><td class="c3">98&micro;s</td><td class="s"><div class="calls"><div class="calls_in"># spent 57&micro;s (15+42) within Bio::Phylo::Util::Exceptions::BEGIN@6 which was called:
+#    once (15&micro;s+42&micro;s) by Bio::Phylo::Identifiable::BEGIN@3 at <a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html#6">line 6</a></div></div>use overload 'bool' =&gt; sub { 1 }, 'fallback' =&gt; 1, '&quot;&quot;' =&gt; \&amp;as_string;<div class="calls"><div class="calls_out"># spent    57&micro;s making 1 call to <a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html#6">Bio::Phylo::Util::Exceptions::BEGIN@6</a>
+# spent    42&micro;s making 1 call to <a href="overload-pm-29-line.html#30">overload::import</a></div></div></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="7"></a>7</td><td class="c3">1</td><td class="c3"><span title="Avg 2&micro;s">2&micro;s</span></td><td></td><td></td><td class="s">our ( @EXPORT_OK, $AUTOLOAD ) = qw'throw';</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="8"></a>8</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s"></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="9"></a>9</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">sub new {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="10"></a>10</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    my $class = shift;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="11"></a>11</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    my %args  = @_;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="12"></a>12</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    my $self  = {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="13"></a>13</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s"></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="14"></a>14</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        #                'error'       =&gt; $args{'error'},</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="15"></a>15</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        #                'description' =&gt; $args{'description'},</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="16"></a>16</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'trace' =&gt; Bio::Phylo::Util::StackTrace-&gt;new,</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="17"></a>17</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'time'  =&gt; CORE::time(),</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="18"></a>18</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'pid'   =&gt; $$,</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="19"></a>19</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'uid'   =&gt; $&lt;,</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="20"></a>20</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'euid'  =&gt; $&gt;,</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="21"></a>21</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'gid'   =&gt; $(,</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="22"></a>22</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'egid'  =&gt; $),</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="23"></a>23</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        %args</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="24"></a>24</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    };</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="25"></a>25</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    return bless $self, $class;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="26"></a>26</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">}</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="27"></a>27</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s"></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="28"></a>28</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">sub as_string {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="29"></a>29</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    my $self        = shift;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="30"></a>30</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    my $error       = $self-&gt;error;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="31"></a>31</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    my $description = $self-&gt;description;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="32"></a>32</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    my $class       = ref $self;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="33"></a>33</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    my $trace       = join &quot;\n&quot;, map { &quot;STACK: $_&quot; } split '\n',</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="34"></a>34</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">      $self-&gt;trace-&gt;as_string;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="35"></a>35</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    return &lt;&lt;&quot;ERROR_HERE_DOC&quot;;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="36"></a>36</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">-------------------------- EXCEPTION ----------------------------</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="37"></a>37</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">Message: $error</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="38"></a>38</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s"></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="39"></a>39</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">An exception of type $class</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="40"></a>40</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">was thrown.</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="41"></a>41</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s"></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="42"></a>42</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">$description</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="43"></a>43</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s"></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="44"></a>44</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">Refer to the Bio::Phylo::Util::Exceptions documentation for more</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="45"></a>45</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">information.</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="46"></a>46</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">------------------------- STACK TRACE ---------------------------</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="47"></a>47</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">$trace        </td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="48"></a>48</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">-----------------------------------------------------------------</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="49"></a>49</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">ERROR_HERE_DOC</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="50"></a>50</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">}</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="51"></a>51</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s"></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="52"></a>52</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">sub throw (@) {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="53"></a>53</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s"></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="54"></a>54</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    # called as static method, with odd args</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="55"></a>55</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    my $self;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="56"></a>56</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    if ( scalar @_ % 2 ) {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="57"></a>57</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        my $class = shift;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="58"></a>58</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        $self = $class-&gt;new(@_);</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="59"></a>59</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    }</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="60"></a>60</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s"></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="61"></a>61</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    # called as function, with even args e.g. throw BadArgs =&gt; 'msg';</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="62"></a>62</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    else {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="63"></a>63</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        my $type  = shift;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="64"></a>64</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        my $class = __PACKAGE__ . '::' . $type;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="65"></a>65</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        if ( $class-&gt;isa('Bio::Phylo::Util::Exceptions') ) {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="66"></a>66</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">            $self = $class-&gt;new( 'error' =&gt; shift, @_ );</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="67"></a>67</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        }</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="68"></a>68</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        else {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="69"></a>69</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">            $self = Bio::Phylo::Util::Exceptions::Generic-&gt;new(</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="70"></a>70</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">                'error' =&gt; shift,</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="71"></a>71</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">                @_</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="72"></a>72</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">            );</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="73"></a>73</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        }</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="74"></a>74</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    }</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="75"></a>75</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s"></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="76"></a>76</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    #         if ( not $ENV{'PERL_DL_NONLAZY'} ) {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="77"></a>77</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    #                 require Bio::Phylo;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="78"></a>78</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    #                 $Bio::Phylo::Util::Logger::TRACEBACK = 1;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="79"></a>79</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    #                 my $logger = Bio::Phylo-&gt;get_logger();</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="80"></a>80</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    #                 $logger-&gt;error($self-&gt;error);</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="81"></a>81</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    #                 $Bio::Phylo::Util::Logger::TRACEBACK = 0;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="82"></a>82</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    #         }</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="83"></a>83</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    die $self;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="84"></a>84</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">}</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="85"></a>85</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s"></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="86"></a>86</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">sub rethrow {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="87"></a>87</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    my $self = shift;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="88"></a>88</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    die $self;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="89"></a>89</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">}</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="90"></a>90</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s"></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="91"></a>91</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">sub caught {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="92"></a>92</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    my $class = shift;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="93"></a>93</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    if (@_) {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="94"></a>94</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        $class = shift;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="95"></a>95</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    }</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="96"></a>96</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    if ($@) {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="97"></a>97</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        if ( blessed $@ and $@-&gt;isa($class) ) {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="98"></a>98</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">            return $@;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="99"></a>99</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        }</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="100"></a>100</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        else {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="101"></a>101</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">            die $@;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="102"></a>102</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        }</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="103"></a>103</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    }</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="104"></a>104</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">}</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="105"></a>105</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s"></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="106"></a>106</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">sub AUTOLOAD {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="107"></a>107</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    my $self  = shift;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="108"></a>108</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    my $field = $AUTOLOAD;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="109"></a>109</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    $field =~ s/.*://;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="110"></a>110</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    return $self-&gt;{$field};</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="111"></a>111</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">}</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="112"></a>112</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s"></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="113"></a>113</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s"><div class="calls"><div class="calls_in"># spent 3.96ms (3.06+899&micro;s) within Bio::Phylo::Util::Exceptions::_make_exceptions which was called:
+#    once (3.06ms+899&micro;s) by Bio::Phylo::Identifiable::BEGIN@3 at <a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html#139">line 139</a></div></div>sub _make_exceptions {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="114"></a>114</td><td class="c3">1</td><td class="c3"><span title="Avg 800ns">800ns</span></td><td></td><td></td><td class="s">    my $class      = shift;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="115"></a>115</td><td class="c3">1</td><td class="c3"><span title="Avg 500ns">500ns</span></td><td></td><td></td><td class="s">    my $root       = shift;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="116"></a>116</td><td class="c3">1</td><td class="c3"><span title="Avg 14&micro;s">14&micro;s</span></td><td></td><td></td><td class="s">    my %exceptions = @_;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="117"></a>117</td><td class="c3">1</td><td class="c3"><span title="Avg 13&micro;s">13&micro;s</span></td><td></td><td></td><td class="s">    for my $exception ( keys %exceptions ) {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="118"></a>118</td><td class="c0">17</td><td class="c3"><span title="Avg 1&micro;s">19&micro;s</span></td><td></td><td></td><td class="s">        my $isa         = $exceptions{$exception}-&gt;{'isa'};</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="119"></a>119</td><td class="c0">17</td><td class="c3"><span title="Avg 1&micro;s">21&micro;s</span></td><td></td><td></td><td class="s">        my @isa         = ref $isa ? @$isa : ($isa);</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="120"></a>120</td><td class="c0">17</td><td class="c3"><span title="Avg 629ns">11&micro;s</span></td><td></td><td></td><td class="s">        my $description = $exceptions{$exception}-&gt;{'description'};</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="121"></a>121</td><td class="c0">17</td><td class="c3"><span title="Avg 2&micro;s">32&micro;s</span></td><td></td><td></td><td class="s">        my $class       = &lt;&lt;&quot;EXCEPTION_CLASS&quot;;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="122"></a>122</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">package ${exception};</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="123"></a>123</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">use vars '\@ISA';</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="124"></a>124</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">\@ISA=qw(@isa);</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="125"></a>125</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">my \$desc;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="126"></a>126</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">sub description { </td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="127"></a>127</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        my \$self = shift;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="128"></a>128</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        if ( \@_ ) {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="129"></a>129</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">                \$desc = shift;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="130"></a>130</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        }</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="131"></a>131</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        return \$desc;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="132"></a>132</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">}</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="133"></a>133</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">1;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="134"></a>134</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">EXCEPTION_CLASS</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="135"></a>135</td><td class="c0">17</td><td class="c0"><span title="Avg 63&micro;s">1.07ms</span></td><td></td><td></td><td class="s">        eval $class;<div class="calls"><div class="calls_out">        # spent   183&micro;s executing statements in <a href="(eval 746)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1157-line.html">string eval</a><br />        # includes 21&micro;s spent executing 2 calls to 2 subs defined therein.
+        # spent   150&micro;s executing statements in <a href="(eval 749)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1160-line.html">string eval</a><br />        # includes 18&micro;s spent executing 2 calls to 2 subs defined therein.
+        # spent   149&micro;s executing statements in <a href="(eval 744)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1155-line.html">string eval</a><br />        # includes 20&micro;s spent executing 2 calls to 2 subs defined therein.
+        # spent   146&micro;s executing statements in <a href="(eval 739)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1150-line.html">string eval</a><br />        # includes 21&micro;s spent executing 2 calls to 2 subs defined therein.
+        # spent   145&micro;s executing statements in <a href="(eval 742)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1153-line.html">string eval</a><br />        # includes 20&micro;s spent executing 2 calls to 2 subs defined therein.
+        # spent   125&micro;s executing statements in <a href="(eval 734)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1145-line.html">string eval</a><br />        # includes 25&micro;s spent executing 2 calls to 2 subs defined therein.
+        # spent   125&micro;s executing statements in <a href="(eval 750)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1161-line.html">string eval</a><br />        # includes 18&micro;s spent executing 2 calls to 2 subs defined therein.
+        # spent   121&micro;s executing statements in <a href="(eval 741)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1152-line.html">string eval</a><br />        # includes 21&micro;s spent executing 2 calls to 2 subs defined therein.
+        # spent   112&micro;s executing statements in <a href="(eval 736)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1147-line.html">string eval</a><br />        # includes 22&micro;s spent executing 2 calls to 2 subs defined therein.
+        # spent   112&micro;s executing statements in <a href="(eval 735)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1146-line.html">string eval</a><br />        # includes 23&micro;s spent executing 2 calls to 2 subs defined therein.
+        # spent   111&micro;s executing statements in <a href="(eval 738)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1149-line.html">string eval</a><br />        # includes 21&micro;s spent executing 2 calls to 2 subs defined therein.
+        # spent   107&micro;s executing statements in <a href="(eval 743)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1154-line.html">string eval</a><br />        # includes 19&micro;s spent executing 2 calls to 2 subs defined therein.
+        # spent   106&micro;s executing statements in <a href="(eval 740)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1151-line.html">string eval</a><br />        # includes 21&micro;s spent executing 2 calls to 2 subs defined therein.
+        # spent   104&micro;s executing statements in <a href="(eval 745)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1156-line.html">string eval</a><br />        # includes 20&micro;s spent executing 2 calls to 2 subs defined therein.
+        # spent   103&micro;s executing statements in <a href="(eval 737)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1148-line.html">string eval</a><br />        # includes 21&micro;s spent executing 2 calls to 2 subs defined therein.
+        # spent    67&micro;s executing statements in <a href="(eval 747)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1158-line.html">string eval</a><br />        # includes 14&micro;s spent executing 2 calls to 2 subs defined therein.
+        # spent    66&micro;s executing statements in <a href="(eval 748)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1159-line.html">string eval</a><br />        # includes 13&micro;s spent executing 2 calls to 2 subs defined therein.</div></div></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="136"></a>136</td><td class="c0">17</td><td class="c0"><span title="Avg 6&micro;s">100&micro;s</span></td><td class="c0">17</td><td class="c3">75&micro;s</td><td class="s">        $exception-&gt;description($description);<div class="calls"><div class="calls_out">        # spent     5&micro;s making 1 call to <a href="(eval 735)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1146-line.html#5">Bio::Phylo::Util::Exceptions::BadString::description</a>
+        # spent     5&micro;s making 1 call to <a href="(eval 744)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1155-line.html#5">Bio::Phylo::Util::Exceptions::BadArgs::description</a>
+        # spent     5&micro;s making 1 call to <a href="(eval 734)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1145-line.html#5">Bio::Phylo::Util::Exceptions::BadFormat::description</a>
+        # spent     5&micro;s making 1 call to <a href="(eval 741)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1152-line.html#5">Bio::Phylo::Util::Exceptions::InvalidData::description</a>
+        # spent     5&micro;s making 1 call to <a href="(eval 736)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1147-line.html#5">Bio::Phylo::Util::Exceptions::BadNumber::description</a>
+        # spent     5&micro;s making 1 call to <a href="(eval 739)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1150-line.html#5">Bio::Phylo::Util::Exceptions::NetworkError::description</a>
+        # spent     5&micro;s making 1 call to <a href="(eval 738)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1149-line.html#5">Bio::Phylo::Util::Exceptions::UnknownMethod::description</a>
+        # spent     5&micro;s making 1 call to <a href="(eval 742)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1153-line.html#5">Bio::Phylo::Util::Exceptions::ExtensionError::description</a>
+        # spent     5&micro;s making 1 call to <a href="(eval 740)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1151-line.html#5">Bio::Phylo::Util::Exceptions::FileError::description</a>
+        # spent     5&micro;s making 1 call to <a href="(eval 737)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1148-line.html#5">Bio::Phylo::Util::Exceptions::ObjectMismatch::description</a>
+        # spent     4&micro;s making 1 call to <a href="(eval 745)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1156-line.html#5">Bio::Phylo::Util::Exceptions::OddHash::description</a>
+        # spent     4&micro;s making 1 call to <a href="(eval 743)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1154-line.html#5">Bio::Phylo::Util::Exceptions::NotImplemented::description</a>
+        # spent     4&micro;s making 1 call to <a href="(eval 749)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1160-line.html#5">Bio::Phylo::Util::Exceptions::System::description</a>
+        # spent     4&micro;s making 1 call to <a href="(eval 748)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1159-line.html#5">Bio::Phylo::Util::Exceptions::OutOfBounds::description</a>
+        # spent     4&micro;s making 1 call to <a href="(eval 750)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1161-line.html#5">Bio::Phylo::Util::Exceptions::API::description</a>
+        # spent     3&micro;s making 1 call to <a href="(eval 746)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1157-line.html#5">Bio::Phylo::Util::Exceptions::Generic::description</a>
+        # spent     3&micro;s making 1 call to <a href="(eval 747)[Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-135]-1158-line.html#5">Bio::Phylo::Util::Exceptions::Deprecated::description</a></div></div></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="137"></a>137</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    }</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="138"></a>138</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">}</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="139"></a>139</td><td class="c3">1</td><td class="c2"><span title="Avg 47&micro;s">47&micro;s</span></td><td class="c3">1</td><td class="c0">3.96ms</td><td class="s">__PACKAGE__-&gt;_make_exceptions(<div class="calls"><div class="calls_out"># spent  3.96ms making 1 call to <a href="Bio-Phylo-Util-Exceptions-pm-1142-line.html#113">Bio::Phylo::Util::Exceptions::_make_exceptions</a></div></div></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="140"></a>140</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s"></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="141"></a>141</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    # root classes</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="142"></a>142</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    'Bio::Phylo::Util::Exceptions',</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="143"></a>143</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    'Bio::Phylo::Util::Exceptions::Generic' =&gt; {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="144"></a>144</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'isa' =&gt; 'Bio::Phylo::Util::Exceptions',</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="145"></a>145</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'description' =&gt;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="146"></a>146</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">          &quot;No further details about this type of error are available.&quot;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="147"></a>147</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    },</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="148"></a>148</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s"></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="149"></a>149</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    # exceptions on method calls</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="150"></a>150</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    'Bio::Phylo::Util::Exceptions::API' =&gt; {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="151"></a>151</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'isa' =&gt; 'Bio::Phylo::Util::Exceptions::Generic',</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="152"></a>152</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'description' =&gt;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="153"></a>153</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">          &quot;No more details about this type of error are available.&quot;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="154"></a>154</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    },</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="155"></a>155</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    'Bio::Phylo::Util::Exceptions::UnknownMethod' =&gt; {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="156"></a>156</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'isa' =&gt; 'Bio::Phylo::Util::Exceptions::API',</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="157"></a>157</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'description' =&gt;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="158"></a>158</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">          &quot;This kind of error happens when a non-existent method is called.&quot;,</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="159"></a>159</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    },</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="160"></a>160</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    'Bio::Phylo::Util::Exceptions::NotImplemented' =&gt; {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="161"></a>161</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'isa' =&gt; 'Bio::Phylo::Util::Exceptions::API',</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="162"></a>162</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'description' =&gt;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="163"></a>163</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">&quot;This kind of error happens when a non-implemented\n(interface) method is called.&quot;,</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="164"></a>164</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    },</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="165"></a>165</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    'Bio::Phylo::Util::Exceptions::Deprecated' =&gt; {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="166"></a>166</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'isa' =&gt; 'Bio::Phylo::Util::Exceptions::API',</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="167"></a>167</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'description' =&gt;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="168"></a>168</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">          &quot;This kind of error happens when a deprecated method is called.&quot;,</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="169"></a>169</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    },</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="170"></a>170</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s"></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="171"></a>171</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    # exceptions on arguments</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="172"></a>172</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    'Bio::Phylo::Util::Exceptions::BadArgs' =&gt; {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="173"></a>173</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'isa' =&gt; 'Bio::Phylo::Util::Exceptions::Generic',</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="174"></a>174</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'description' =&gt;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="175"></a>175</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">&quot;This kind of error happens when bad or incomplete arguments\nare provided.&quot;,</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="176"></a>176</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    },</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="177"></a>177</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    'Bio::Phylo::Util::Exceptions::BadString' =&gt; {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="178"></a>178</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'isa' =&gt; 'Bio::Phylo::Util::Exceptions::BadArgs',</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="179"></a>179</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'description' =&gt;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="180"></a>180</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">&quot;This kind of error happens when an unsafe string argument is\nprovided.&quot;,</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="181"></a>181</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    },</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="182"></a>182</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    'Bio::Phylo::Util::Exceptions::OddHash' =&gt; {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="183"></a>183</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'isa' =&gt; 'Bio::Phylo::Util::Exceptions::BadArgs',</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="184"></a>184</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'description' =&gt;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="185"></a>185</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">&quot;This kind of error happens when an uneven number\nof arguments (so no key/value pairs) was provided.&quot;,</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="186"></a>186</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    },</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="187"></a>187</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    'Bio::Phylo::Util::Exceptions::ObjectMismatch' =&gt; {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="188"></a>188</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'isa' =&gt; 'Bio::Phylo::Util::Exceptions::BadArgs',</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="189"></a>189</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'description' =&gt;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="190"></a>190</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">&quot;This kind of error happens when an invalid object\nargument is provided.&quot;,</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="191"></a>191</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    },</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="192"></a>192</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    'Bio::Phylo::Util::Exceptions::InvalidData' =&gt; {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="193"></a>193</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'isa' =&gt; [</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="194"></a>194</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">            'Bio::Phylo::Util::Exceptions::BadString',</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="195"></a>195</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">            'Bio::Phylo::Util::Exceptions::BadFormat',</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="196"></a>196</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        ],</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="197"></a>197</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'description' =&gt;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="198"></a>198</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">          &quot;This kind of error happens when invalid character data is\nprovided.&quot;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="199"></a>199</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    },</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="200"></a>200</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    'Bio::Phylo::Util::Exceptions::OutOfBounds' =&gt; {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="201"></a>201</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'isa' =&gt; 'Bio::Phylo::Util::Exceptions::BadArgs',</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="202"></a>202</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'description' =&gt;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="203"></a>203</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">          &quot;This kind of error happens when an index is outside of its range.&quot;,</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="204"></a>204</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    },</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="205"></a>205</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    'Bio::Phylo::Util::Exceptions::BadNumber' =&gt; {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="206"></a>206</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'isa' =&gt; 'Bio::Phylo::Util::Exceptions::Generic',</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="207"></a>207</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'description' =&gt;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="208"></a>208</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">&quot;This kind of error happens when an invalid numerical argument\nis provided.&quot;,</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="209"></a>209</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    },</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="210"></a>210</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s"></td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="211"></a>211</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    # system exceptions</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="212"></a>212</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    'Bio::Phylo::Util::Exceptions::System' =&gt; {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="213"></a>213</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'isa' =&gt; 'Bio::Phylo::Util::Exceptions::Generic',</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="214"></a>214</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'description' =&gt;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="215"></a>215</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">          &quot;This kind of error happens when there is a system misconfiguration.&quot;,</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="216"></a>216</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    },</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="217"></a>217</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    'Bio::Phylo::Util::Exceptions::FileError' =&gt; {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="218"></a>218</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'isa' =&gt; 'Bio::Phylo::Util::Exceptions::System',</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="219"></a>219</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'description' =&gt;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="220"></a>220</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">          &quot;This kind of error happens when a file can not be accessed.&quot;,</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="221"></a>221</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    },</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="222"></a>222</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    'Bio::Phylo::Util::Exceptions::NetworkError' =&gt; {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="223"></a>223</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'isa' =&gt; 'Bio::Phylo::Util::Exceptions::System',</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="224"></a>224</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'description' =&gt;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="225"></a>225</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">&quot;This kind of error happens when a network resource can not be accessed.&quot;,</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="226"></a>226</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    },</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="227"></a>227</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    'Bio::Phylo::Util::Exceptions::ExtensionError' =&gt; {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="228"></a>228</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'isa' =&gt; [</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="229"></a>229</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">            'Bio::Phylo::Util::Exceptions::System',</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="230"></a>230</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">            'Bio::Phylo::Util::Exceptions::BadFormat',</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="231"></a>231</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        ],</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="232"></a>232</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'description' =&gt;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="233"></a>233</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">&quot;This kind of error happens when an extension module can not be\nloaded.&quot;,</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="234"></a>234</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    },</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="235"></a>235</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    'Bio::Phylo::Util::Exceptions::BadFormat' =&gt; {</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="236"></a>236</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'isa' =&gt; 'Bio::Phylo::Util::Exceptions::System',</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="237"></a>237</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">        'description' =&gt;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="238"></a>238</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">&quot;This kind of error happens when a bad\nparse or unparse format was specified.&quot;,</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="239"></a>239</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">    },</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="240"></a>240</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">);</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="241"></a>241</td><td class="c3">1</td><td class="c1"><span title="Avg 53&micro;s">53&micro;s</span></td><td></td><td></td><td class="s">1;</td></tr>
+<tr><td class="h"><a name="242"></a>242</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td class="s">__END__</td></tr>
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+        
+            <script type="text/javascript"> $(document).ready(function() { 
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+        $("#subs_table").tablesorter({
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+            }
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+ } ); </script>
+        
+        <div class="footer">Report produced by the
+        <a href="http://search.cpan.org/dist/Devel-NYTProf/">NYTProf 4.06</a>
+        Perl profiler, developed by
+        <a href="http://www.linkedin.com/in/timbunce">Tim Bunce</a> and
+        <a href="http://code.nytimes.com">Adam Kaplan</a>.
+        </div>
+        <br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br />
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