Update admin_users to be able to remove traditions from users
[scpubgit/stemmatology.git] / lib / Text / Tradition.pm
1 package Text::Tradition;
2
3 use JSON qw / from_json /;
4 use Module::Load;
5 use Moose;
6 use Text::Tradition::Collation;
7 use Text::Tradition::Stemma;
8 use Text::Tradition::Witness;
9 use Text::Tradition::User;
10
11 use vars qw( $VERSION );
12 $VERSION = "0.5";
13
14 has 'collation' => (
15     is => 'ro',
16     isa => 'Text::Tradition::Collation',
17     writer => '_save_collation',
18     );
19
20 has 'witness_hash' => (
21     traits => ['Hash'],
22     isa => 'HashRef[Text::Tradition::Witness]',
23     handles => {
24         witness     => 'get',
25         add_witness => 'set',
26         del_witness => 'delete',
27         has_witness => 'exists',
28         witnesses   => 'values',
29     },
30     default => sub { {} },
31     );
32
33 has 'name' => (
34     is => 'rw',
35     isa => 'Str',
36     default => 'Tradition',
37     );
38     
39 has 'language' => (
40         is => 'rw',
41         isa => 'Str',
42         predicate => 'has_language',
43         );
44     
45 has 'stemmata' => (
46         traits => ['Array'],
47         isa => 'ArrayRef[Text::Tradition::Stemma]',
48         handles => {
49                 stemmata => 'elements',
50                 _add_stemma => 'push',
51                 stemma => 'get',
52                 stemma_count => 'count',
53                 clear_stemmata => 'clear',
54         },
55         default => sub { [] },
56         );
57
58 has 'user' => (
59     is => 'rw',
60     isa => 'Text::Tradition::User',
61     required => 0,
62     predicate => 'has_user',
63     clearer => 'clear_user',
64     );
65   
66 # Create the witness before trying to add it
67 around 'add_witness' => sub {
68     my $orig = shift;
69     my $self = shift;
70     # TODO allow add of a Witness object?
71     my %args = @_ == 1 ? %{$_[0]} : @_;
72     $args{'tradition'} = $self;
73     $args{'language'} = $self->language 
74         if( $self->language && !exists $args{'language'} );
75     my $new_wit = Text::Tradition::Witness->new( %args );
76     $self->$orig( $new_wit->sigil => $new_wit );
77     return $new_wit;
78 };
79
80 # Allow deletion of witness by object as well as by sigil
81 around 'del_witness' => sub {
82     my $orig = shift;
83     my $self = shift;
84     my @key_args;
85     foreach my $arg ( @_ ) {
86         push( @key_args, 
87               ref( $arg ) eq 'Text::Tradition::Witness' ? $arg->sigil : $arg );
88     }
89     return $self->$orig( @key_args );
90 };
91
92 # Don't allow an empty hash value
93 around 'witness' => sub {
94     my( $orig, $self, $arg ) = @_;
95     return unless $self->has_witness( $arg );
96     return $self->$orig( $arg );
97 };
98
99 =head1 NAME
100
101 Text::Tradition - a software model for a set of collated texts
102
103 =head1 SYNOPSIS
104
105   use Text::Tradition;
106   my $t = Text::Tradition->new( 
107     'name' => 'this is a text',
108     'input' => 'TEI',
109     'file' => '/path/to/tei_parallel_seg_file.xml' );
110
111   my @text_wits = $t->witnesses();
112   my $manuscript_a = $t->witness( 'A' );
113
114   $t = Text::Tradition->new();
115   $t->add_witness( 'sourcetype' => 'xmldesc', 
116     'file' => '/path/to/teitranscription.xml' );
117   $t->add_witness( 'sourcetype => 'plaintext', 'sigil' => 'Q',
118     'string' => 'The quick brown fox jumped over the lazy dogs' );
119   ## TODO
120   $t->collate_texts;
121   
122   my $text_path_svg = $t->collation->as_svg();
123   ## See Text::Tradition::Collation for more on text collation itself
124     
125 =head1 DESCRIPTION
126
127 Text::Tradition is a library for representation and analysis of collated
128 texts, particularly medieval ones.  A 'tradition' refers to the aggregation
129 of surviving versions of a text, generally preserved in multiple
130 manuscripts (or 'witnesses').  A Tradition object thus has one more more
131 Witnesses, as well as a Collation that represents the unity of all versions
132 of the text.
133
134 =head1 METHODS
135
136 =head2 new
137
138 Creates and returns a new text tradition object.  The following options are
139 accepted.
140
141 General options:
142
143 =over 4
144
145 =item B<name> - The name of the text.
146
147 =back
148
149 Initialization based on a collation file:
150
151 =over 4
152
153 =item B<input> - The input format of the collation file.  Can be one of the
154 following:
155
156 =over 4
157
158 =item * Self - a GraphML format produced by this module
159
160 =item * CollateX - a GraphML format produced by CollateX
161
162 =item * CTE - a TEI XML format produced by Classical Text Editor
163
164 =item * JSON - an alignment table in JSON format, as produced by CollateX and other tools
165
166 =item * KUL - a specific CSV format for variants, not documented here
167
168 =item * TEI - a TEI parallel segmentation format file
169
170 =item * Tabular - a comma- or tab-separated collation.  Takes an additional
171 option, 'sep_char', which defaults to the tab character.
172
173 =back
174
175 =item B<file> - The name of the file that contains the data.  One of 'file'
176 or 'string' should be specified.
177
178 =item B<string> - A text string that contains the data.  One of 'file' or
179 'string' should be specified.
180
181 =item B<base> - The name of a text file that contains the base text, to be
182 used with input formats that require it (currently only KUL).
183
184 =back
185
186 Initialization based on a list of witnesses [NOT YET IMPLEMENTED]:
187
188 =over 4
189
190 =item B<witnesses> - A reference to an array of Text::Tradition::Witness
191 objects that carry the text to be collated.
192
193 =item B<collator> - A reference to a collation program that will accept
194 Witness objects.
195
196 =back
197
198 =head2 B<witnesses>
199
200 Return the Text::Tradition::Witness objects associated with this tradition,
201 as an array.
202
203 =head2 B<witness>( $sigil )
204
205 Returns the Text::Tradition::Witness object whose sigil is $sigil, or undef
206 if there is no such object within the tradition.
207
208 =head2 B<add_witness>( %opts )
209
210 Instantiate a new witness with the given options (see documentation for
211 Text::Tradition::Witness) and add it to the tradition.
212
213 =head2 B<del_witness>( $sigil )
214
215 Delete the witness with the given sigil from the tradition.  Returns the
216 witness object for the deleted witness.
217
218 =begin testing
219
220 use_ok( 'Text::Tradition', "can use module" );
221
222 my $t = Text::Tradition->new( 'name' => 'empty' );
223 is( ref( $t ), 'Text::Tradition', "initialized an empty Tradition object" );
224 is( $t->name, 'empty', "object has the right name" );
225 is( scalar $t->witnesses, 0, "object has no witnesses" );
226
227 my $simple = 't/data/simple.txt';
228 my $s = Text::Tradition->new( 
229     'name'  => 'inline', 
230     'input' => 'Tabular',
231     'file'  => $simple,
232     );
233 is( ref( $s ), 'Text::Tradition', "initialized a Tradition object" );
234 is( $s->name, 'inline', "object has the right name" );
235 is( scalar $s->witnesses, 3, "object has three witnesses" );
236
237 my $wit_a = $s->witness('A');
238 is( ref( $wit_a ), 'Text::Tradition::Witness', "Found a witness A" );
239 if( $wit_a ) {
240     is( $wit_a->sigil, 'A', "Witness A has the right sigil" );
241 }
242 is( $s->witness('X'), undef, "There is no witness X" );
243 ok( !exists $s->{'witnesses'}->{'X'}, "Witness key X not created" );
244
245 my $wit_d = $s->add_witness( 'sigil' => 'D', 'sourcetype' => 'collation' );
246 is( ref( $wit_d ), 'Text::Tradition::Witness', "new witness created" );
247 is( $wit_d->sigil, 'D', "witness has correct sigil" );
248 is( scalar $s->witnesses, 4, "object now has four witnesses" );
249
250 my $del = $s->del_witness( 'D' );
251 is( $del, $wit_d, "Deleted correct witness" );
252 is( scalar $s->witnesses, 3, "object has three witnesses again" );
253
254 # TODO test initialization by witness list when we have it
255
256 =end testing
257
258 =cut
259     
260
261 sub BUILD {
262     my( $self, $init_args ) = @_;
263     
264     # First, make a collation object. This will use only those arguments in
265     # init_args that apply to the collation.
266         my $collation = Text::Tradition::Collation->new( %$init_args,
267                                                                                                         'tradition' => $self );
268         $self->_save_collation( $collation );
269
270     if( exists $init_args->{'input'} ) {
271         # Call the appropriate parser on the given data
272         my @format_standalone = qw/ Self CollateText CollateX CTE JSON TEI Tabular /;
273         my @format_basetext = qw/ KUL /;
274         my $use_base;
275         my $format = $init_args->{'input'};
276         if( $format && !( grep { $_ eq $format } @format_standalone )
277             && !( grep { $_ eq $format } @format_basetext ) ) {
278             warn "Unrecognized input format $format; not parsing";
279             return;
280         }
281         if( $format && grep { $_ eq $format } @format_basetext ) {
282             $use_base = 1;
283             if( !exists $init_args->{'base'} ) {
284                 warn "Cannot make a collation from $format without a base text";
285                 return;
286             }
287         }
288
289         # Now do the parsing. 
290         if( $format ) {
291             if( $use_base ) { 
292                 $format = 'BaseText';   # Use the BaseText module for parsing,
293                                         # but retain the original input arg.
294             }
295             my $mod = "Text::Tradition::Parser::$format";
296             load( $mod );
297             $mod->can('parse')->( $self, $init_args );
298         }
299     }
300     return $self;
301 }
302
303 =head2 add_json_witnesses( $jsonstring, $options )
304
305 Adds a set of witnesses from a JSON array specification. This is a wrapper
306 to parse the JSON and call add_witness (with the specified $options) for
307 each element therein.
308
309 =cut
310
311 sub add_json_witnesses {
312         my( $self, $jsonstr, $extraopts ) = @_;
313         my $witarray = from_json( $jsonstr );
314         foreach my $witspec ( @{$witarray->{witnesses}} ) {
315                 my $opts = $extraopts || {};
316                 $opts->{'sourcetype'} = 'json';
317                 $opts->{'object'} = $witspec;
318                 $self->add_witness( $opts );
319         }
320 }
321
322 =head2 add_stemma( $dotfile )
323
324 Initializes a Text::Tradition::Stemma object from the given dotfile,
325 and associates it with the tradition.
326
327 =begin testing
328
329 use Text::Tradition;
330
331 my $t = Text::Tradition->new( 
332     'name'  => 'simple test', 
333     'input' => 'Tabular',
334     'file'  => 't/data/simple.txt',
335     );
336
337 is( $t->stemma_count, 0, "No stemmas added yet" );
338 my $s;
339 ok( $s = $t->add_stemma( dotfile => 't/data/simple.dot' ), "Added a simple stemma" );
340 is( ref( $s ), 'Text::Tradition::Stemma', "Got a stemma object returned" );
341 is( $t->stemma_count, 1, "Tradition claims to have a stemma" );
342 is( $t->stemma(0), $s, "Tradition hands back the right stemma" );
343
344 =end testing
345
346 =cut
347
348 sub add_stemma {
349         my $self = shift;
350         my %opts = @_;
351         my $stemma_fh;
352         if( $opts{'dotfile'} ) {
353                 open $stemma_fh, '<', $opts{'dotfile'}
354                         or warn "Could not open file " . $opts{'dotfile'};
355         } elsif( $opts{'dot'} ) {
356                 my $str = $opts{'dot'};
357                 open $stemma_fh, '<', \$str;
358         }
359         # Assume utf-8
360         binmode $stemma_fh, ':utf8';
361         my $stemma = Text::Tradition::Stemma->new( 
362                 'collation' => $self->collation,
363                 'dot' => $stemma_fh );
364         $self->_add_stemma( $stemma ) if $stemma;
365         return $stemma;
366 }
367
368 sub lemmatize {
369         my $self = shift;
370         unless( $self->has_language ) {
371                 warn "Please set a language to lemmatize a tradition";
372                 return;
373         }
374         my $mod = "Text::Tradition::Language::" . $self->language;
375         load( $mod );
376         $mod->can( 'lemmatize' )->( $self );
377 }
378
379 no Moose;
380 __PACKAGE__->meta->make_immutable;
381
382
383 =head1 BUGS / TODO
384
385 =over
386
387 =item * Allow tradition to be initialized via passing to a collator.
388
389 =back
390
391 =head1 LICENSE
392
393 This package is free software and is provided "as is" without express
394 or implied warranty.  You can redistribute it and/or modify it under
395 the same terms as Perl itself.
396
397 =head1 AUTHOR
398
399 Tara L Andrews E<lt>aurum@cpan.orgE<gt>