base/t/text_tradition_collation.t

   1 #!/usr/bin/perl -w
   2
   3 use strict;
   4 use Test::More 'no_plan';
   5 $| = 1;
   6
   7
   8
   9 # =begin testing
  10 {
  11 use Text::Tradition;
  12
  13 my $cxfile = 't/data/Collatex-16.xml';
  14 my $t = Text::Tradition->new(
  15     'name'  => 'inline',
  16     'input' => 'CollateX',
  17     'file'  => $cxfile,
  18     );
  19 my $c = $t->collation;
  20
  21 my $rno = scalar $c->readings;
  22 # Split n21 ('unto') for testing purposes
  23 my $new_r = $c->add_reading( { 'id' => 'n21p0', 'text' => 'un', 'join_next' => 1 } );
  24 my $old_r = $c->reading( 'n21' );
  25 $old_r->alter_text( 'to' );
  26 $c->del_path( 'n20', 'n21', 'A' );
  27 $c->add_path( 'n20', 'n21p0', 'A' );
  28 $c->add_path( 'n21p0', 'n21', 'A' );
  29 $c->add_relationship( 'n21', 'n22', { type => 'collated', scope => 'local' } );
  30 $c->flatten_ranks();
  31 ok( $c->reading( 'n21p0' ), "New reading exists" );
  32 is( scalar $c->readings, $rno, "Reading add offset by flatten_ranks" );
  33
  34 # Combine n3 and n4 ( with his )
  35 $c->merge_readings( 'n3', 'n4', 1 );
  36 ok( !$c->reading('n4'), "Reading n4 is gone" );
  37 is( $c->reading('n3')->text, 'with his', "Reading n3 has both words" );
  38
  39 # Collapse n9 and n10 ( rood / root )
  40 $c->merge_readings( 'n9', 'n10' );
  41 ok( !$c->reading('n10'), "Reading n10 is gone" );
  42 is( $c->reading('n9')->text, 'rood', "Reading n9 has an unchanged word" );
  43
  44 # Combine n21 and n21p0
  45 my $remaining = $c->reading('n21');
  46 $remaining ||= $c->reading('n22');  # one of these should still exist
  47 $c->merge_readings( 'n21p0', $remaining, 1 );
  48 ok( !$c->reading('n21'), "Reading $remaining is gone" );
  49 is( $c->reading('n21p0')->text, 'unto', "Reading n21p0 merged correctly" );
  50 }
  51
  52
  53
  54 # =begin testing
  55 {
  56 use Text::Tradition;
  57 use TryCatch;
  58
  59 my $t = Text::Tradition->new(
  60     'name'  => 'inline',
  61     'input' => 'Self',
  62     'file'  => 't/data/legendfrag.xml',
  63     );
  64 my $c = $t->collation;
  65
  66 my %rdg_ids;
  67 map { $rdg_ids{$_} = 1 } $c->readings;
  68 $c->merge_related( 'orthographic' );
  69 is( scalar( $c->readings ), keys( %rdg_ids ) - 8,
  70         "Successfully collapsed orthographic variation" );
  71 map { $rdg_ids{$_} = undef } qw/ r13.3 r11.4 r8.5 r8.2 r7.7 r7.5 r7.4 r7.1 /;
  72 foreach my $rid ( keys %rdg_ids ) {
  73         my $exp = $rdg_ids{$rid};
  74         is( !$c->reading( $rid ), !$exp, "Reading $rid correctly " .
  75                 ( $exp ? "retained" : "removed" ) );
  76 }
  77 ok( $c->linear, "Graph is still linear" );
  78 try {
  79         $c->calculate_ranks; # This should succeed
  80         ok( 1, "Can still calculate ranks on the new graph" );
  81 } catch {
  82         ok( 0, "Rank calculation on merged graph failed: $@" );
  83 }
  84
  85 # Now add some transpositions
  86 $c->add_relationship( 'r8.4', 'r10.4', { type => 'transposition' } );
  87 $c->merge_related( 'transposition' );
  88 is( scalar( $c->readings ), keys( %rdg_ids ) - 9,
  89         "Transposed relationship is merged away" );
  90 ok( !$c->reading('r8.4'), "Correct transposed reading removed" );
  91 ok( !$c->linear, "Graph is no longer linear" );
  92 try {
  93         $c->calculate_ranks; # This should fail
  94         ok( 0, "Rank calculation happened on nonlinear graph?!" );
  95 } catch ( Text::Tradition::Error $e ) {
  96         is( $e->message, 'Cannot calculate ranks on a non-linear graph',
  97                 "Rank calculation on merged graph threw an error" );
  98 }
  99 }
 100
 101
 102
 103 # =begin testing
 104 {
 105 use Test::More::UTF8;
 106 use Text::Tradition;
 107 use TryCatch;
 108
 109 my $st = Text::Tradition->new( 'input' => 'Self', 'file' => 't/data/collatecorr.xml' );
 110 is( ref( $st ), 'Text::Tradition', "Got a tradition from test file" );
 111 ok( $st->has_witness('Ba96'), "Tradition has the affected witness" );
 112
 113 my $sc = $st->collation;
 114 my $numr = 17;
 115 ok( $sc->reading('n131'), "Tradition has the affected reading" );
 116 is( scalar( $sc->readings ), $numr, "There are $numr readings in the graph" );
 117 is( $sc->end->rank, 14, "There are fourteen ranks in the graph" );
 118
 119 # Detach the erroneously collated reading
 120 my( $newr, @del_rdgs ) = $sc->duplicate_reading( 'n131', 'Ba96' );
 121 ok( $newr, "New reading was created" );
 122 ok( $sc->reading('n131_0'), "Detached the bad collation with a new reading" );
 123 is( scalar( $sc->readings ), $numr + 1, "A reading was added to the graph" );
 124 is( $sc->end->rank, 10, "There are now only ten ranks in the graph" );
 125 my $csucc = $sc->common_successor( 'n131', 'n131_0' );
 126 is( $csucc->id, 'n136', "Found correct common successor to duped reading" );
 127
 128 # Check that the bad transposition is gone
 129 is( scalar @del_rdgs, 1, "Deleted reading was returned by API call" );
 130 is( $sc->get_relationship( 'n130', 'n135' ), undef, "Bad transposition relationship is gone" );
 131
 132 # The collation should not be fixed
 133 my @pairs = $sc->identical_readings();
 134 is( scalar @pairs, 0, "Not re-collated yet" );
 135 # Fix the collation
 136 ok( $sc->merge_readings( 'n124', 'n131_0' ), "Collated the readings correctly" );
 137 @pairs = $sc->identical_readings( start => 'n124', end => $csucc->id );
 138 is( scalar @pairs, 3, "Found three more identical readings" );
 139 is( $sc->end->rank, 11, "The ranks shifted appropriately" );
 140 $sc->flatten_ranks();
 141 is( scalar( $sc->readings ), $numr - 3, "Now we are collated correctly" );
 142
 143 # Check that we can't "duplicate" a reading with no wits or with all wits
 144 try {
 145         my( $badr, @del_rdgs ) = $sc->duplicate_reading( 'n124' );
 146         ok( 0, "Reading duplication without witnesses throws an error" );
 147 } catch( Text::Tradition::Error $e ) {
 148         like( $e->message, qr/Must specify one or more witnesses/,
 149                 "Reading duplication without witnesses throws the expected error" );
 150 } catch {
 151         ok( 0, "Reading duplication without witnesses threw the wrong error" );
 152 }
 153
 154 try {
 155         my( $badr, @del_rdgs ) = $sc->duplicate_reading( 'n124', 'Ba96', 'Mü11475' );
 156         ok( 0, "Reading duplication with all witnesses throws an error" );
 157 } catch( Text::Tradition::Error $e ) {
 158         like( $e->message, qr/Cannot join all witnesses/,
 159                 "Reading duplication with all witnesses throws the expected error" );
 160 } catch {
 161         ok( 0, "Reading duplication with all witnesses threw the wrong error" );
 162 }
 163 }
 164
 165
 166
 167 # =begin testing
 168 {
 169 use Text::Tradition;
 170 use TryCatch;
 171
 172 my $READINGS = 311;
 173 my $PATHS = 361;
 174
 175 my $datafile = 't/data/florilegium_tei_ps.xml';
 176 my $tradition = Text::Tradition->new( 'input' => 'TEI',
 177                                       'name' => 'test0',
 178                                       'file' => $datafile,
 179                                       'linear' => 1 );
 180
 181 ok( $tradition, "Got a tradition object" );
 182 is( scalar $tradition->witnesses, 13, "Found all witnesses" );
 183 ok( $tradition->collation, "Tradition has a collation" );
 184
 185 my $c = $tradition->collation;
 186 is( scalar $c->readings, $READINGS, "Collation has all readings" );
 187 is( scalar $c->paths, $PATHS, "Collation has all paths" );
 188 is( scalar $c->relationships, 0, "Collation has all relationships" );
 189
 190 # Add a few relationships
 191 $c->add_relationship( 'w123', 'w125', { 'type' => 'collated' } );
 192 $c->add_relationship( 'w193', 'w196', { 'type' => 'collated' } );
 193 $c->add_relationship( 'w257', 'w262', { 'type' => 'transposition' } );
 194
 195 # Now write it to GraphML and parse it again.
 196
 197 my $graphml = $c->as_graphml;
 198 my $st = Text::Tradition->new( 'input' => 'Self', 'string' => $graphml );
 199 is( scalar $st->collation->readings, $READINGS, "Reparsed collation has all readings" );
 200 is( scalar $st->collation->paths, $PATHS, "Reparsed collation has all paths" );
 201 is( scalar $st->collation->relationships, 3, "Reparsed collation has new relationships" );
 202
 203 # Now add a stemma, write to GraphML, and look at the output.
 204 SKIP: {
 205         skip "Analysis module not present", 3 unless $tradition->can( 'add_stemma' );
 206         my $stemma = $tradition->add_stemma( 'dotfile' => 't/data/florilegium.dot' );
 207         is( ref( $stemma ), 'Text::Tradition::Stemma', "Parsed dotfile into stemma" );
 208         is( $tradition->stemmata, 1, "Tradition now has the stemma" );
 209         $graphml = $c->as_graphml;
 210         like( $graphml, qr/digraph/, "Digraph declaration exists in GraphML" );
 211 }
 212 }
 213
 214
 215
 216 # =begin testing
 217 {
 218 use Text::Tradition;
 219 use Text::CSV;
 220
 221 my $READINGS = 311;
 222 my $PATHS = 361;
 223 my $WITS = 13;
 224 my $WITAC = 4;
 225
 226 my $datafile = 't/data/florilegium_tei_ps.xml';
 227 my $tradition = Text::Tradition->new( 'input' => 'TEI',
 228                                       'name' => 'test0',
 229                                       'file' => $datafile,
 230                                       'linear' => 1 );
 231
 232 my $c = $tradition->collation;
 233 # Export the thing to CSV
 234 my $csvstr = $c->as_csv();
 235 # Count the columns
 236 my $csv = Text::CSV->new({ sep_char => ',', binary => 1 });
 237 my @lines = split(/\n/, $csvstr );
 238 ok( $csv->parse( $lines[0] ), "Successfully parsed first line of CSV" );
 239 is( scalar( $csv->fields ), $WITS + $WITAC, "CSV has correct number of witness columns" );
 240 my @q_ac = grep { $_ eq 'Q'.$c->ac_label } $csv->fields;
 241 ok( @q_ac, "Found a layered witness" );
 242
 243 my $t2 = Text::Tradition->new( input => 'Tabular',
 244                                                            name => 'test2',
 245                                                            string => $csvstr,
 246                                                            sep_char => ',' );
 247 is( scalar $t2->collation->readings, $READINGS, "Reparsed CSV collation has all readings" );
 248 is( scalar $t2->collation->paths, $PATHS, "Reparsed CSV collation has all paths" );
 249
 250 # Now do it with TSV
 251 my $tsvstr = $c->as_tsv();
 252 my $t3 = Text::Tradition->new( input => 'Tabular',
 253                                                            name => 'test3',
 254                                                            string => $tsvstr,
 255                                                            sep_char => "\t" );
 256 is( scalar $t3->collation->readings, $READINGS, "Reparsed TSV collation has all readings" );
 257 is( scalar $t3->collation->paths, $PATHS, "Reparsed TSV collation has all paths" );
 258
 259 my $table = $c->alignment_table;
 260 my $noaccsv = $c->as_csv({ noac => 1 });
 261 my @noaclines = split(/\n/, $noaccsv );
 262 ok( $csv->parse( $noaclines[0] ), "Successfully parsed first line of no-ac CSV" );
 263 is( scalar( $csv->fields ), $WITS, "CSV has correct number of witness columns" );
 264 is( $c->alignment_table, $table, "Request for CSV did not alter the alignment table" );
 265
 266 my $safecsv = $c->as_csv({ safe_ac => 1});
 267 my @safelines = split(/\n/, $safecsv );
 268 ok( $csv->parse( $safelines[0] ), "Successfully parsed first line of safe CSV" );
 269 is( scalar( $csv->fields ), $WITS + $WITAC, "CSV has correct number of witness columns" );
 270 @q_ac = grep { $_ eq 'Q__L' } $csv->fields;
 271 ok( @q_ac, "Found a sanitized layered witness" );
 272 is( $c->alignment_table, $table, "Request for CSV did not alter the alignment table" );
 273 }
 274
 275
 276
 277 # =begin testing
 278 {
 279 use Text::Tradition;
 280
 281 my $cxfile = 't/data/Collatex-16.xml';
 282 my $t = Text::Tradition->new(
 283     'name'  => 'inline',
 284     'input' => 'CollateX',
 285     'file'  => $cxfile,
 286     );
 287 my $c = $t->collation;
 288
 289 # Make an svg
 290 my $table = $c->alignment_table;
 291 ok( $c->has_cached_table, "Alignment table was cached" );
 292 is( $c->alignment_table, $table, "Cached table returned upon second call" );
 293 $c->calculate_ranks;
 294 is( $c->alignment_table, $table, "Cached table retained with no rank change" );
 295 $c->add_relationship( 'n13', 'n23', { type => 'repetition' } );
 296 is( $c->alignment_table, $table, "Alignment table unchanged after non-colo relationship add" );
 297 $c->add_relationship( 'n24', 'n23', { type => 'spelling' } );
 298 isnt( $c->alignment_table, $table, "Alignment table changed after colo relationship add" );
 299 }
 300
 301
 302
 303 # =begin testing
 304 {
 305 use Text::Tradition;
 306
 307 my $cxfile = 't/data/Collatex-16.xml';
 308 my $t = Text::Tradition->new(
 309     'name'  => 'inline',
 310     'input' => 'CollateX',
 311     'file'  => $cxfile,
 312     );
 313 my $c = $t->collation;
 314
 315 my @common = $c->calculate_common_readings();
 316 is( scalar @common, 8, "Found correct number of common readings" );
 317 my @marked = sort $c->common_readings();
 318 is( scalar @common, 8, "All common readings got marked as such" );
 319 my @expected = qw/ n1 n11 n16 n19 n20 n5 n6 n7 /;
 320 is_deeply( \@marked, \@expected, "Found correct list of common readings" );
 321 }
 322
 323
 324
 325 # =begin testing
 326 {
 327 use Text::Tradition;
 328
 329 my $cxfile = 't/data/Collatex-16.xml';
 330 my $t = Text::Tradition->new(
 331     'name'  => 'inline',
 332     'input' => 'CollateX',
 333     'file'  => $cxfile,
 334     );
 335 my $c = $t->collation;
 336
 337 is( $c->common_predecessor( 'n24', 'n23' )->id,
 338     'n20', "Found correct common predecessor" );
 339 is( $c->common_successor( 'n24', 'n23' )->id,
 340     '__END__', "Found correct common successor" );
 341
 342 is( $c->common_predecessor( 'n19', 'n17' )->id,
 343     'n16', "Found correct common predecessor for readings on same path" );
 344 is( $c->common_successor( 'n21', 'n10' )->id,
 345     '__END__', "Found correct common successor for readings on same path" );
 346 }
 347
 348
 349
 350
 351 1;