base/t/text_tradition_collation.t

   1 #!/usr/bin/perl -w
   2
   3 use strict;
   4 use Test::More 'no_plan';
   5 $| = 1;
   6
   7
   8
   9 # =begin testing
  10 {
  11 use Text::Tradition;
  12
  13 my $cxfile = 't/data/Collatex-16.xml';
  14 my $t = Text::Tradition->new(
  15     'name'  => 'inline',
  16     'input' => 'CollateX',
  17     'file'  => $cxfile,
  18     );
  19 my $c = $t->collation;
  20
  21 my $rno = scalar $c->readings;
  22 # Split n21 ('unto') for testing purposes
  23 my $new_r = $c->add_reading( { 'id' => 'n21p0', 'text' => 'un', 'join_next' => 1 } );
  24 my $old_r = $c->reading( 'n21' );
  25 $old_r->alter_text( 'to' );
  26 $c->del_path( 'n20', 'n21', 'A' );
  27 $c->add_path( 'n20', 'n21p0', 'A' );
  28 $c->add_path( 'n21p0', 'n21', 'A' );
  29 $c->add_relationship( 'n21', 'n22', { type => 'collated', scope => 'local' } );
  30 $c->flatten_ranks();
  31 ok( $c->reading( 'n21p0' ), "New reading exists" );
  32 is( scalar $c->readings, $rno, "Reading add offset by flatten_ranks" );
  33
  34 # Combine n3 and n4 ( with his )
  35 $c->merge_readings( 'n3', 'n4', 1 );
  36 ok( !$c->reading('n4'), "Reading n4 is gone" );
  37 is( $c->reading('n3')->text, 'with his', "Reading n3 has both words" );
  38
  39 # Collapse n9 and n10 ( rood / root )
  40 $c->merge_readings( 'n9', 'n10' );
  41 ok( !$c->reading('n10'), "Reading n10 is gone" );
  42 is( $c->reading('n9')->text, 'rood', "Reading n9 has an unchanged word" );
  43
  44 # Combine n21 and n21p0
  45 my $remaining = $c->reading('n21');
  46 $remaining ||= $c->reading('n22');  # one of these should still exist
  47 $c->merge_readings( 'n21p0', $remaining, 1 );
  48 ok( !$c->reading('n21'), "Reading $remaining is gone" );
  49 is( $c->reading('n21p0')->text, 'unto', "Reading n21p0 merged correctly" );
  50 }
  51
  52
  53
  54 # =begin testing
  55 {
  56 use Test::More::UTF8;
  57 use Text::Tradition;
  58 use TryCatch;
  59
  60 my $st = Text::Tradition->new( 'input' => 'Self', 'file' => 't/data/collatecorr.xml' );
  61 is( ref( $st ), 'Text::Tradition', "Got a tradition from test file" );
  62 ok( $st->has_witness('Ba96'), "Tradition has the affected witness" );
  63
  64 my $sc = $st->collation;
  65 my $numr = 17;
  66 ok( $sc->reading('n131'), "Tradition has the affected reading" );
  67 is( scalar( $sc->readings ), $numr, "There are $numr readings in the graph" );
  68 is( $sc->end->rank, 14, "There are fourteen ranks in the graph" );
  69
  70 # Detach the erroneously collated reading
  71 my( $newr, @del_rdgs ) = $sc->duplicate_reading( 'n131', 'Ba96' );
  72 ok( $newr, "New reading was created" );
  73 ok( $sc->reading('n131_0'), "Detached the bad collation with a new reading" );
  74 is( scalar( $sc->readings ), $numr + 1, "A reading was added to the graph" );
  75 is( $sc->end->rank, 10, "There are now only ten ranks in the graph" );
  76 my $csucc = $sc->common_successor( 'n131', 'n131_0' );
  77 is( $csucc->id, 'n136', "Found correct common successor to duped reading" );
  78
  79 # Check that the bad transposition is gone
  80 is( scalar @del_rdgs, 1, "Deleted reading was returned by API call" );
  81 is( $sc->get_relationship( 'n130', 'n135' ), undef, "Bad transposition relationship is gone" );
  82
  83 # The collation should not be fixed
  84 my @pairs = $sc->identical_readings();
  85 is( scalar @pairs, 0, "Not re-collated yet" );
  86 # Fix the collation
  87 ok( $sc->merge_readings( 'n124', 'n131_0' ), "Collated the readings correctly" );
  88 @pairs = $sc->identical_readings( start => 'n124', end => $csucc->id );
  89 is( scalar @pairs, 3, "Found three more identical readings" );
  90 is( $sc->end->rank, 11, "The ranks shifted appropriately" );
  91 $sc->flatten_ranks();
  92 is( scalar( $sc->readings ), $numr - 3, "Now we are collated correctly" );
  93
  94 # Check that we can't "duplicate" a reading with no wits or with all wits
  95 try {
  96         my( $badr, @del_rdgs ) = $sc->duplicate_reading( 'n124' );
  97         ok( 0, "Reading duplication without witnesses throws an error" );
  98 } catch( Text::Tradition::Error $e ) {
  99         like( $e->message, qr/Must specify one or more witnesses/,
 100                 "Reading duplication without witnesses throws the expected error" );
 101 } catch {
 102         ok( 0, "Reading duplication without witnesses threw the wrong error" );
 103 }
 104
 105 try {
 106         my( $badr, @del_rdgs ) = $sc->duplicate_reading( 'n124', 'Ba96', 'Mü11475' );
 107         ok( 0, "Reading duplication with all witnesses throws an error" );
 108 } catch( Text::Tradition::Error $e ) {
 109         like( $e->message, qr/Cannot join all witnesses/,
 110                 "Reading duplication with all witnesses throws the expected error" );
 111 } catch {
 112         ok( 0, "Reading duplication with all witnesses threw the wrong error" );
 113 }
 114 }
 115
 116
 117
 118 # =begin testing
 119 {
 120 use Text::Tradition;
 121 use TryCatch;
 122
 123 my $READINGS = 311;
 124 my $PATHS = 361;
 125
 126 my $datafile = 't/data/florilegium_tei_ps.xml';
 127 my $tradition = Text::Tradition->new( 'input' => 'TEI',
 128                                       'name' => 'test0',
 129                                       'file' => $datafile,
 130                                       'linear' => 1 );
 131
 132 ok( $tradition, "Got a tradition object" );
 133 is( scalar $tradition->witnesses, 13, "Found all witnesses" );
 134 ok( $tradition->collation, "Tradition has a collation" );
 135
 136 my $c = $tradition->collation;
 137 is( scalar $c->readings, $READINGS, "Collation has all readings" );
 138 is( scalar $c->paths, $PATHS, "Collation has all paths" );
 139 is( scalar $c->relationships, 0, "Collation has all relationships" );
 140
 141 # Add a few relationships
 142 $c->add_relationship( 'w123', 'w125', { 'type' => 'collated' } );
 143 $c->add_relationship( 'w193', 'w196', { 'type' => 'collated' } );
 144 $c->add_relationship( 'w257', 'w262', { 'type' => 'transposition' } );
 145
 146 # Now write it to GraphML and parse it again.
 147
 148 my $graphml = $c->as_graphml;
 149 my $st = Text::Tradition->new( 'input' => 'Self', 'string' => $graphml );
 150 is( scalar $st->collation->readings, $READINGS, "Reparsed collation has all readings" );
 151 is( scalar $st->collation->paths, $PATHS, "Reparsed collation has all paths" );
 152 is( scalar $st->collation->relationships, 3, "Reparsed collation has new relationships" );
 153
 154 # Now add a stemma, write to GraphML, and look at the output.
 155 SKIP: {
 156         skip "Analysis module not present", 3 unless $tradition->can( 'add_stemma' );
 157         my $stemma = $tradition->add_stemma( 'dotfile' => 't/data/florilegium.dot' );
 158         is( ref( $stemma ), 'Text::Tradition::Stemma', "Parsed dotfile into stemma" );
 159         is( $tradition->stemmata, 1, "Tradition now has the stemma" );
 160         $graphml = $c->as_graphml;
 161         like( $graphml, qr/digraph/, "Digraph declaration exists in GraphML" );
 162 }
 163 }
 164
 165
 166
 167 # =begin testing
 168 {
 169 use Text::Tradition;
 170 use Text::CSV;
 171
 172 my $READINGS = 311;
 173 my $PATHS = 361;
 174 my $WITS = 13;
 175 my $WITAC = 4;
 176
 177 my $datafile = 't/data/florilegium_tei_ps.xml';
 178 my $tradition = Text::Tradition->new( 'input' => 'TEI',
 179                                       'name' => 'test0',
 180                                       'file' => $datafile,
 181                                       'linear' => 1 );
 182
 183 my $c = $tradition->collation;
 184 # Export the thing to CSV
 185 my $csvstr = $c->as_csv();
 186 # Count the columns
 187 my $csv = Text::CSV->new({ sep_char => ',', binary => 1 });
 188 my @lines = split(/\n/, $csvstr );
 189 ok( $csv->parse( $lines[0] ), "Successfully parsed first line of CSV" );
 190 is( scalar( $csv->fields ), $WITS + $WITAC, "CSV has correct number of witness columns" );
 191 my @q_ac = grep { $_ eq 'Q'.$c->ac_label } $csv->fields;
 192 ok( @q_ac, "Found a layered witness" );
 193
 194 my $t2 = Text::Tradition->new( input => 'Tabular',
 195                                                            name => 'test2',
 196                                                            string => $csvstr,
 197                                                            sep_char => ',' );
 198 is( scalar $t2->collation->readings, $READINGS, "Reparsed CSV collation has all readings" );
 199 is( scalar $t2->collation->paths, $PATHS, "Reparsed CSV collation has all paths" );
 200
 201 # Now do it with TSV
 202 my $tsvstr = $c->as_tsv();
 203 my $t3 = Text::Tradition->new( input => 'Tabular',
 204                                                            name => 'test3',
 205                                                            string => $tsvstr,
 206                                                            sep_char => "\t" );
 207 is( scalar $t3->collation->readings, $READINGS, "Reparsed TSV collation has all readings" );
 208 is( scalar $t3->collation->paths, $PATHS, "Reparsed TSV collation has all paths" );
 209
 210 my $table = $c->alignment_table;
 211 my $noaccsv = $c->as_csv({ noac => 1 });
 212 my @noaclines = split(/\n/, $noaccsv );
 213 ok( $csv->parse( $noaclines[0] ), "Successfully parsed first line of no-ac CSV" );
 214 is( scalar( $csv->fields ), $WITS, "CSV has correct number of witness columns" );
 215 is( $c->alignment_table, $table, "Request for CSV did not alter the alignment table" );
 216
 217 my $safecsv = $c->as_csv({ safe_ac => 1});
 218 my @safelines = split(/\n/, $safecsv );
 219 ok( $csv->parse( $safelines[0] ), "Successfully parsed first line of safe CSV" );
 220 is( scalar( $csv->fields ), $WITS + $WITAC, "CSV has correct number of witness columns" );
 221 @q_ac = grep { $_ eq 'Q__L' } $csv->fields;
 222 ok( @q_ac, "Found a sanitized layered witness" );
 223 is( $c->alignment_table, $table, "Request for CSV did not alter the alignment table" );
 224 }
 225
 226
 227
 228 # =begin testing
 229 {
 230 use Text::Tradition;
 231
 232 my $cxfile = 't/data/Collatex-16.xml';
 233 my $t = Text::Tradition->new(
 234     'name'  => 'inline',
 235     'input' => 'CollateX',
 236     'file'  => $cxfile,
 237     );
 238 my $c = $t->collation;
 239
 240 # Make an svg
 241 my $table = $c->alignment_table;
 242 ok( $c->has_cached_table, "Alignment table was cached" );
 243 is( $c->alignment_table, $table, "Cached table returned upon second call" );
 244 $c->calculate_ranks;
 245 is( $c->alignment_table, $table, "Cached table retained with no rank change" );
 246 $c->add_relationship( 'n13', 'n23', { type => 'repetition' } );
 247 is( $c->alignment_table, $table, "Alignment table unchanged after non-colo relationship add" );
 248 $c->add_relationship( 'n24', 'n23', { type => 'spelling' } );
 249 isnt( $c->alignment_table, $table, "Alignment table changed after colo relationship add" );
 250 }
 251
 252
 253
 254 # =begin testing
 255 {
 256 use Text::Tradition;
 257
 258 my $cxfile = 't/data/Collatex-16.xml';
 259 my $t = Text::Tradition->new(
 260     'name'  => 'inline',
 261     'input' => 'CollateX',
 262     'file'  => $cxfile,
 263     );
 264 my $c = $t->collation;
 265
 266 my @common = $c->calculate_common_readings();
 267 is( scalar @common, 8, "Found correct number of common readings" );
 268 my @marked = sort $c->common_readings();
 269 is( scalar @common, 8, "All common readings got marked as such" );
 270 my @expected = qw/ n1 n11 n16 n19 n20 n5 n6 n7 /;
 271 is_deeply( \@marked, \@expected, "Found correct list of common readings" );
 272 }
 273
 274
 275
 276 # =begin testing
 277 {
 278 use Text::Tradition;
 279
 280 my $cxfile = 't/data/Collatex-16.xml';
 281 my $t = Text::Tradition->new(
 282     'name'  => 'inline',
 283     'input' => 'CollateX',
 284     'file'  => $cxfile,
 285     );
 286 my $c = $t->collation;
 287
 288 is( $c->common_predecessor( 'n24', 'n23' )->id,
 289     'n20', "Found correct common predecessor" );
 290 is( $c->common_successor( 'n24', 'n23' )->id,
 291     '__END__', "Found correct common successor" );
 292
 293 is( $c->common_predecessor( 'n19', 'n17' )->id,
 294     'n16', "Found correct common predecessor for readings on same path" );
 295 is( $c->common_successor( 'n21', 'n10' )->id,
 296     '__END__', "Found correct common successor for readings on same path" );
 297 }
 298
 299
 300
 301
 302 1;